aspera在mac和win下的使用命令整理

最新推荐文章于 2024-07-22 21:25:01 发布

zd200572

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分类专栏：生物信息文章标签： aspera ascp ena fastq

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这两天在用mac下载ena的fastq数据，发现aspera connect，windows和mac版本的死活不会用呢，于是就学习了一下，发现一样是可以使用命令行的，这里是mac的，后面再整理下win的。

Mac的命令，找的比较辛苦

/Users/zd200572/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources
cp asperaweb_id_dsa.openssh ~
ascp -QT -l 300m -P33001 -L- -k1 -i asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:vol1/fastq/ERR101/005/ERR1018205/ERR1018205_1.fastq.gz /Volumes/MacOS/BioData/metagenomics

这样，就可以享受榨干带宽的乐趣了，不得不说这个技术的强大。–k1参数还可以实现断点续传。

有了mac的经验，win的相对轻松了

安装好程序后，源文件在：E:\Users\shenyou\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp.exe

密钥文件在E:\Users\shenyou\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\etc\asperaweb_id_dsa.openssh

所以，命令就稍微修改一下就可以了。

ascp.exe -QT -l 300m -P33001 -L- -k1 -i  ..\asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:vol1/fastq/ERR101/005/ERR1018205/ERR1018205_1.fastq.gz  .#最后这个点是目标目录，.代表当前目录