同位素未标记13C标记和2H标记的2,4-二氯苯氧乙酸（2,4-D）处理拟南芥属T87细胞

最新推荐文章于 2021-04-14 15:24:20 发布
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分类专栏： 同位素
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研究利用LC/HRMS/MS技术，结合13C和2H标记的2,4-D处理拟南芥属T87细胞，建立高准确度代谢物检测方法。通过对不同时间点的数据分析，鉴定出26个2,4-D代谢物，包括10个已知和16个新发现的代谢产物，揭示了2,4-D在细胞内的代谢途径和时间变化规律。" 132660559,19694686,理解CEP运算符：源码分析与示例,"['大数据', 'CEP', '开发语言', '事件处理']
摘要由CSDN通过智能技术生成

同位素未标记13C标记和2H标记的2,4-二氯苯氧乙酸（2,4-D）处理拟南芥属T87细胞

建立高准确度和普适性的外源性代谢物检测和鉴定分析方法对于评价药物等化合物的安全性至关重要。基于液相色谱-四极杆串联高分辨质谱技术（LC/HRMS/MS），先应用稳定同位素标记目标原型化合物（13C和2H），再进行特征峰识别和配对同位素峰过滤鉴定代谢物，通过代谢物随时间变化的轮廓分析确证代谢物，建立了高准确度的外源性代谢物检测和鉴定分析方法。

该研究使用未标记、13C标记和2H标记的2,4-二氯苯氧乙酸（2,4-D）处理拟南芥属T87细胞，经液相色谱高分辨质谱分析后进行特征峰识别和配对同位素峰过滤，得到83个候选代谢物，确认了26个2,4-D的代谢物，其中包括10个已报道代谢物和16个新发现的代谢物。

具体研究策略见图1。

该研究共包括三个数据集：

1、未加药组和2,4-D给药组；

2、2,4-D给药组和13C8-2,4-D给药组；

3、2,4-D给药组和2H5-2,4-D给药组，每组细胞样品均在加药0、1、3、7和10天时间点取样分析。经质谱分析后数据集1得到30853个特征峰，扣除未加药组内源性特征峰并进行35Cl/37Cl同位素表型分析后，得到潜在代谢物645个，但这其中仍可能包含大量假阳性结果；数据集2得到34559个特征峰，对2,4-D给药组和13C8-2,4-D给药组在0、1、3、7和10天时间点的特征峰峰面积轮廓进行统计分析（火山图分析，log2-fold change>|1|和p<0.05）排除内源性代谢物，得到差异特征峰1626个，再进行同位素特征峰配对过滤（Δm/z 8.0272 Da，质量偏差＜5ppm），得到候选代谢物81个；数据集3分析处理流程与数据集2相同，得到候选代谢物76个。综合数据集2和数据集3数据，总共得到候选代谢物83个，三个数据集分析流程见图2。

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13C同位素脉冲标记法浅析（实验解析）
zhaocaijinbaoya的博客
12-16 6912
13C脉冲标记技术是一种研究土壤有机碳输入、输出的方法，有着灵敏度高、扰动小和理论上较合理等优点。它可以定量根际沉积碳、植物输入到根部的碳和根际呼吸。只要在植物生育期内进行一系列脉冲标记，便能合理估算植物输入到地下各组分的碳量。此外，利用13C脉冲标记法可以确定植物的根际激发效应。 实例：每次选取4盆小麦进行13C脉冲标记。脉冲标记装置如下图所示。分别在播种后75天（分蘖期）、168天（拔节期）、188天（花期）和202天（灌浆期）进行4次标记。 ①标记前, 连接CO2吸收装置, 让标记过程中根际呼..
稳定性同位素内标是质谱方法（稳定性同位素稀释法）
zhaocaijinbaoya的博客
12-16 4474
稳定性同位素内标是质谱方法（稳定性同位素稀释法）独有的，没有别的临床检测方法用到同位素内标。比如光吸收和免疫的方法，都无法分辨出被检测物和同位素内标的区别，因为它们的理化性质太接近了。如果真的加进内标，那测出来的值肯定大大的偏高。只有质谱才能把同位素内标和要检测的物质分得开，虽然它们的差别只有几个道尔顿。现在的内标基本都是稳定同位素标记的，最常见的是D和13C。同位素内标和被检测物是同一个物质，但是其中的几个氢原子被氘所取代，或者是12C换成了13C，理化性质基本不变。 ...
同位素标记法的应用分析
zhaocaijinbaoya的博客
12-14 4461
同位素标记法的应用分析 同位素用于追踪物质运行和变化过程时，叫做示踪元素。用示踪元素标记的化合物，化学性质不变。人们可以根据这种化合物的放射性，有关的一系列化学反应进行追踪。这种科学研究方法叫做同位素标记法。 同位素标记法的大致流程为：用同位素标记某物质或结构→同位素标记的物质或结构与无同位素标记的物质或结构混合→分析同位素存在的物质或结构及其数量的变化→得出结论。 在解答同位素示踪法应用问题时，先需分清所标记的化合物，根据示踪元素的移动位置判断生化反应的进程，进而了解细胞的结构和功能、化学物质的变化、反应
稳定性同位素示踪技术和放射性同位素示踪技术的研究进展
zhaocaijinbaoya的博客
12-01 2927
稳定性同位素示踪技术和放射性同位素示踪技术的研究进展 同位素示踪所利用的放射性核素或稳定性核素及它们的化合物，与自然界存在的相应普通元素及其化合物之间的化学性质和生物学性质是相同的，只是具有不同的核物理性质。因此，就可以用同位素作为一种标记，制成含有同位素的标记化合物（如标记食物，药物和代谢物质等）代替相应的非标记化合物。利用放射性同位素不断地放出特征射线的核物理性质，就可以用核探测器随时追踪它在体内或体外的位置、数量及其转变等，稳定性同位素虽然不释放射线，但可以利用它与普通相应同位素的质量之...
同位素标记脱氢丙氨酸（Dha）
zhaocaijinbaoya的博客
12-17 2318
氢丙氨酸（Dha）是一种天然存在的氨基酸，它可以通过半胱氨酸（Cys）衍生生成。因此认为蛋白中的Cys转化为Dha后，Dha中的α，β不饱和的酰胺捕获重水中亲电D+，随后再与硫醇化合物发生迈克尔加成反应，可实现蛋白质位点选择性的无痕氘代标记。为了使Dha与硫醇化合物S-R反应能够得到Cys的产物，测试了R=H, Ac和PO32-等时化合物的反应活性和脱保护情况, 发现磷酸化的硫醇化合物均能成功地反应插入和脱保护。先在组蛋白H3的10号Cys位点H3-Cys10进行验证，利用双烷基化的脱除试剂...
同位素标记动物药代动力学在体内的吸收、分布、代谢、排泄试验
zhaocaijinbaoya的博客
12-04 2210
针对于目前的生物技术类药物在啮齿类动物中的临床前药代动力学研究中，通常利用同位素示踪技术研究其在体内的吸收、分布、代谢、排泄试验等，从而获得该药物在啮齿类动物体内的药代动力学参数、分布特征，及排泄特征等。下面根据利用同位素示踪技术研究药物的药代动力学的内容介绍核医学应用研究室所具备的条件和需要改善之处。 主要利用Iodogen 法或氯胺-T法将125I 标记到目标蛋白药物上，标记过程严格按照所用的标记方法进行操作。纯度高于98%的蛋白类药物，且不含任何赋形剂或稳定剂，基本全部能够标记成功。 标记之后的标.
99mtc:锝99m同位素-小分子/抗体/纳米粒子等材料放射性标记材料标记实验的设计原则
zhaocaijinbaoya的博客
04-14 1911
99mtc:锝99m同位素-小分子/抗体/纳米粒子等材料放射性标记材料 99mtc:锝99m同位素-小分子/抗体/纳米粒子等材料放射性标记材料 标记实验的设计原则 设计一个放射性同位素的标记实验应从实验的目的性，实验所具备的条件和对放射性的防护水平三方面着手考虑。原则上必须从两个主要方面来设计放射性标记实验：一是必须寻求有效的、可重复的测定放射性强度的条件，二是必须选择一个合适的比活度 λqδ（单位是原子/时间/分子，dpm/mol或ci/mol）。其中，λ=-dN’dt/N’为该处放射性原子核.
同位素标记其他的研究方法和技术
zhaocaijinbaoya的博客
12-22 1841
同位素标记其他的研究方法和技术 (1)假说—演绎法——孟德尔两大遗传定律的发现，摩尔根证明基因在染色体上(以白眼雄果蝇为材料)，DNA半保留复制方式的证明，温特生长素的发现实验。 (2)类比推理法——萨顿提出“基因在染色体上”。 (3)创立假说——膜的成分和结构的初步阐明，达尔文提出植物向光性假说。 (4)模型构建法——构建细胞亚显微结构物理模型，构建DNA双螺旋结构物理模型，构建光合作用、种群特征、细胞分裂等概念模型，构建种群增长两种数学模型(公式、“J”型与“S”型曲线)，构建减数分裂、血糖调节过程物理
制备氘标记N-烷基类药物及其衍生物（图文说明）
zhaocaijinbaoya的博客
12-24 1835
制备氘标记N-烷基类药物及其衍生物（图文说明） 利用传统方法，目前已有多款N-烷基氘代药物开发出来，部分已经进入临床阶段（图1a）。基于光催化水分解技术，在此提出以氘标记水和甲醇为新型组合型烷基化试剂，从而替代、高毒、剧烈的氘烷基化试剂，并实现氘标记个数精准控制（图1b）。以对甲基苯胺和二苯胺为例，以CH3OH/H2O, CH3OD/D2O, CD3OD/H2O, CD3OD/D2O等方式进行组合时，可实现伯胺二烷基化产物、仲胺烷基化产物氘标记个数精准控制（精准引入-CH3, -CDH2, -CD2H,
18f:氟-18同位素 Fluorine-18标记小分子化合物/多肽/纳米粒子/抗体及其他动物代谢
zhaocaijinbaoya的博客
04-14 1811
18f:氟-18同位素 Fluorine-18标记小分子化合物/多肽/纳米粒子/抗体及其他动物代谢 18f:氟-18同位素 Fluorine-18标记小分子化合物/多肽/纳米粒子/抗体及其他动物代谢 放射性同位素标记/radioisotope labeling 用于同位素标记的示踪原子为放射性同位素的标记/同位素示踪利用放射性核素化合物 同位素标记法/示踪元素标记 同位素标记法：同位素可用于追踪物质的运行和变化规律。借助同位素原子以研究有机反应历程的方法。即同位素用于追踪物质运行和变化过程时.
动物代谢成像（SPECT/PET）放射性同位素标记实验/18f/99mtc/125l/68Ga放射性标记
zhaocaijinbaoya的博客
04-14 1769
动物代谢成像（SPECT/PET）放射性同位素标记实验/18f/99mtc/125l/68Ga放射性标记 动物代谢成像（SPECT/PET）放射性同位素标记实验/18f/99mtc/125l/68Ga放射性标记 实验过程 选择放射性同位素的剂量 同位素必须能经得起稀释，使其较后样品的放射性不能低于本底，一般来说放射性同位素在生物体内不是完全均匀地被稀释，可能在某些器官、组织、细胞、某些分子中有选择性地蓄积，蓄积的部分放射性就会很强，在这种情况下，应以相关部位对标记剂的蓄积率来考虑标记剂用量。在细胞培
LC分离方法-reverse-phase liquid chromatography-RPLC反相液相色谱法
zhaocaijinbaoya的博客
12-22 1567
反相液相色谱法（reverse-phase liquid chromatography，RPLC）是代谢组学中先常见和实用的一种LC分离方法。但是他的缺点是对于强极性物质保留较差。亲水相互作用液相色谱（hydrophilic interaction liquid chromatography，HILIC）是近年来色谱领域研究的热点之一。它通过采用强极性度固定相，并且结合高比例有机相和低比例水相作为流动相。此前文章报道的RPLC和HILIC是主要集中在特征峰的数目方面，还没有文章系统比较这两种方法在代谢组学上
稳定性/放射性同位素的化学合成
zhaocaijinbaoya的博客
12-04 1557
放射同位素标记试剂的合成 放射性化合物的合成制备，受限于其有限资源和较高的费用，因此一般新药进入实质性研发阶段才采用放射性标记化合物进行示踪研究。放射性化合物在药物研发中的应用多数倾向于限制在临床前或临床研究阶段。而进入临床前和临床研究阶段之前的相关研究中通常可用直接氚化等新技术，如用氚水、氚气、氚复合物以及近期发展起来的氚化试剂等目标化合物分子中直接引入氚原子，得到简单的非定位氚标记目标化合物，而不必进行放射性合成方法进行定位标记。 此类方法有一定缺陷，如在体内易于与体内的氢原子交换而导致原药及其代谢产
同位素标记测定未知代谢物的先新方法
zhaocaijinbaoya的博客
12-28 1404
同位素标记测定未知代谢物的先新方法 特征代谢的确切机制及其在植物进化中的重要性仍然是个谜。特征代谢的产物及其相应的生物合成基因对于理解某些代谢普遍存在的原因至关重要。尽管基于质谱（MS）的代谢组学使我们能够获得未知特征代谢物、已知代谢物及其对应异构体或类似物的结构特征数据，但分析方法的拓展仍然十分必要。在此，回顾总结了使用稳定同位素标记识别未知特征代谢物的先进分析方法。 迄今，地球上大约391000种维管植物中的225种基因组已被测序。由于测序及数据分析技术方法的进步，预计这一数字在不久的将来会迅速增加
使用稳定同位素标记测定已知和未知代谢物
zhaocaijinbaoya的博客
12-28 1242
使用稳定同位素标记测定已知和未知代谢物 手动识别所有检测离子的分子式需要相当长的时间。利用MS-DIAL程序和13C标记，诞生了一种化学信息学方法，可以利用测定的C数和LC-MS/MS结果明确分子式。在目前的数据库中没有找到的分子式通常不作进一步的分析。图3的研究案例表明这项研究分析了这些未匹配的代谢物的化学成分，并在12种植物中匹配上了1133种代谢物。异构体/类似物，即糖基化或羟基化的类似物，可以根据MS/MS的相似性、同源性和生物反应因子获得。这些类似物的鉴定可能有助于发现相应的生物合成基因，包括糖
基于Springboot和Vue的图书借还管理系统源码 图书借还管理系统代码（高分毕设）
最新发布
07-28
图书借还管理系统源码（高分毕设），个人经导师指导并认可通过的98分毕业设计项目，主要针对计算机相关专业的正在做毕设的学生和需要项目实战练习的学习者。也可作为课程设计、期末大作业。包含全部项目源码[代码]、该项目可以直接作为毕设使用。项目技术栈：前端是vue，后端是springboot，项目代码都经过严格调试，代码没有任何bug！ 系统源码（高分毕设），个人经导师指导并认可通过的98分毕业设计项目，主要针对计算机相关专业的正在做毕设的学生和需要项目实战练习的学习者。也可作为课程设计、期末大作业。包含全部项目源码[代码]、该项目可以直接作为毕设使用。项目技术栈：前端是vue，后端是springboot，项目代码都经过严格调试，代码没有任何bug！ 系统源码（高分毕设），个人经导师指导并认可通过的98分毕业设计项目，主要针对计算机相关专业的正在做毕设的学生和需要项目实战练习的学习者。也可作为课程设计、期末大作业。包含全部项目源码[代码]、该项目可以直接作为毕设使用。项目技术栈：前端是vue，后端是springboot，项目代码都经过严格调试，代码没有任何bug！
SM2、SM3和SM4用C语言编写
06-07
SM2、SM3和SM4都是国密算法，其中SM2用于数字签名、公钥加密和密钥交换，SM3用于哈希函数，SM4用于对称加密。下面是一个简单的用C语言实现的SM2、SM3和SM4算法示例： ### SM2 ```c #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> #include "sm2.h" int main() { unsigned char msg[] = "Hello, world!"; unsigned char pubkey[] = "04438d5e596cc9c4b13c9f4d6b4663d8f7b7d6a9c0c2f6b59f4c7d74f2a8d7d5" "d6b2e2b236dc9b6a6e7f4fc6a5f2a9c2e5ff2ee5dbb13e7af0c2a4f051c49731"; unsigned char prikey[] = "6e5a9b0a4f91b40c3e2a8b4b4d5c635cf3d2c9fa1abf4248cef2a09a6e1b3f01"; unsigned char signature[128]; int len; sm2_init(); len = sizeof(msg) - 1; sm2_sign(msg, len, prikey, signature); printf("signature: "); for (int i = 0; i < 64; i++) { printf("%02x", signature[i]); } printf("\n"); sm2_verify(msg, len, pubkey, signature); printf("verify success\n"); return 0; } ``` 这个示例中，我们使用了sm2.h头文件提供的函数来进行SM2算法的数字签名和验证操作。首先，我们使用sm2_init函数来初始化SM2算法的参数。然后，我们定义了一个消息msg、一个公钥pubkey和一个私钥prikey。我们使用sm2_sign函数来对消息进行签名操作，并将签名结果保存在signature中。最后，我们使用sm2_verify函数来验证签名是否正确。 ### SM3 ```c #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> #include "sm3.h" int main() { unsigned char msg[] = "Hello, world!"; unsigned char digest[32]; sm3_init(); sm3_update(msg, sizeof(msg) - 1); sm3_final(digest); printf("digest: "); for (int i = 0; i < 32; i++) { printf("%02x", digest[i]); } printf("\n"); return 0; } ``` 这个示例中，我们使用了sm3.h头文件提供的函数来进行SM3算法的哈希操作。首先，我们使用sm3_init函数来初始化SM3算法的参数。然后，我们使用sm3_update函数来更新消息。最后，我们使用sm3_final函数来获取哈希结果。 ### SM4 ```c #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> #include "sm4.h" int main() { unsigned char key[] = "0123456789abcdef"; unsigned char iv[] = "0123456789abcdef"; unsigned char plaintext[] = "Hello, world!"; unsigned char ciphertext[128]; unsigned char decryptedtext[128]; int len; sm4_init(); len = sizeof(plaintext) - 1; sm4_cbc_encrypt(key, iv, plaintext, len, ciphertext); printf("ciphertext: "); for (int i = 0; i < len; i++) { printf("%02x", ciphertext[i]); } printf("\n"); sm4_cbc_decrypt(key, iv, ciphertext, len, decryptedtext); printf("decryptedtext: "); for (int i = 0; i < len; i++) { printf("%c", decryptedtext[i]); } printf("\n"); return 0; } ``` 这个示例中，我们使用了sm4.h头文件提供的函数来进行SM4算法的加密和解密操作。首先，我们使用sm4_init函数来初始化SM4算法的参数。然后，我们定义了一个密钥key、一个初始化向量iv和一个明文plaintext。我们使用sm4_cbc_encrypt函数来对明文进行加密操作，并将密文保存在ciphertext中。最后，我们使用sm4_cbc_decrypt函数来对密文进行解密操作，并将解密结果保存在decryptedtext中。
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