scRNA-seq与 bulk RNA-seq技术比较综述

1. scRNA-seq技术发展

在过去十多年，高通量测序技术广泛应用于生物和医学领域，转录组测序（RNA-seq）用于测定物种基因或转录本表达，但传统基于群体细胞的转录组测序技术（bulk RNA-seq）掩盖了细胞间表达异质性（cellular heterogeneity）。近年来，单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术蓬勃发展，可在单细胞水平揭示全基因组基因表达情况，利于研究细胞间表达异质性，目前已广泛应用于多种物种组织和细胞系。

单细胞转录组测序技术的发展史(Svensson et al. NATURE PROTOCOLS, 2018)：

2. scRNA-seq 的应用

1. 探索组织中的细胞类型：确定组织中存在哪些细胞类型。
2. 识别未知 / 罕见细胞类型或状态：发现新的或稀少的细胞类型及其状态。
3. 阐明分化过程或跨时间 / 状态的基因表达变化：了解细胞分化等过程中基因表达的动态改变。
4. 识别条件间特定细胞类型中差异表达的基因：如在不同处理或疾病状态下，特定细胞类型中基因表达的差异。
5. 结合空间、调控和 / 或蛋白质信息探索细胞类型的表达变化<