微生物代谢组学联合分析简介
在肠道中,微生物与宿主之间进行密切的信息交流,在代谢、免疫、神经系统调控中起重要作用。不同组成的微生物能影响机体体重、消化功能、抵御感染和自身免疫疾病的患病风险,此外,还能影响机体对药物的反应。这些肠道微生物主要通过小分子的代谢物与宿主进行密切的相互作用。微生物的代谢组学可发现肠道微生物随宿主病理生理变化的关键代谢物,为微生物组-宿主互作机制研究提供线索。
通过微生物组+代谢组联合分析,可以对微生物与代谢物之间的相互关系进行研究,如微生物菌群与其生存环境的关系,代谢物对微生物稳态的影响,菌群改变在复杂疾病中的作用机理,微生物菌群的生理作用与其代谢产物及其代谢功能之间的相互作用关系及微生物菌群参与的多种代谢调控途径等。 在宿主生理、疾病病理、药物药理等方面具有良好的应用前景。
应用领域
- 生物医学领域:疾病基础研究(肿瘤,代谢性疾病,自身免疫性疾病,神经性疾病等),临床诊断,疾病分型,早期标志物研究,个性化治疗。
- 医药领域:药物作用机理,药物靶点,药效评价,药物开发等。
- 农业领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等。
- 食品领域:肉类及乳品质研究,食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。
- 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全。
- 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,极端环境研究等。
应用案列
Fig1. Integrated correlation-based network analysis of microbes and metabolites. Pearson’s correlation analysis from the entire network in the CRC group and H group. (Yang Y ,et al. 2019)
文献出处
- Yang Y ,et al. Integrated microbiome and metabolome analysis reveals a novel interplay between commensal bacteria and metabolites in colorectal cancer[J]. Theranostics, 2019, 9(14).
其他文献案列
Yachida S ,et al. Metagenomic and metabolomic analyses reveal distinct stage-specific phenotypes of the gut microbiota in colorectal cancer[J]. Nature Medicine, 2019, 25(6):968-976.