LncRNA与代谢组联合分析
简介
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸但不具备编码蛋白质能力的分子。普遍存在于人类和各种真核生物中,lncRNA具有广泛转录、种类众多、功能多样等特点,是多种生物学过程的必需调节剂,并通过多种机制起作用。代谢组是生物体在内外调控下基因转录的最终结果,是生物体表型的物质基础和表型的直接体现者。
在系统生物学研究时代,生物发育过程复杂多变,基因调控网络复杂,单独用一种组学对系统生物学进行研究,往往比较片面。lncRNA测序数据与代谢组数据进行关联分析,深入到调控基因以及功能基因,从原因和结果两个层次分析生物体的内在变化,锁定与代谢物变化重点通路,构建核心调控网络,系统全面地解析疾病发生发展的复杂机制,进而从整体上解释生物学问题。
分析思路
关联分析内容
- KEGG通路富集分析。
- 相关性热图。
- 相关性网络图。
- 典范对应分析(CCA analysis)。
- O2PLS模型关联分析。
- 鉴定关键LncRNA/mRNA/代谢物。