LncRNA与代谢组联合分析

LncRNA与代谢组联合分析

简介
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸但不具备编码蛋白质能力的分子。普遍存在于人类和各种真核生物中,lncRNA具有广泛转录、种类众多、功能多样等特点,是多种生物学过程的必需调节剂,并通过多种机制起作用。代谢组是生物体在内外调控下基因转录的最终结果,是生物体表型的物质基础和表型的直接体现者。

在系统生物学研究时代,生物发育过程复杂多变,基因调控网络复杂,单独用一种组学对系统生物学进行研究,往往比较片面。lncRNA测序数据与代谢组数据进行关联分析,深入到调控基因以及功能基因,从原因和结果两个层次分析生物体的内在变化,锁定与代谢物变化重点通路,构建核心调控网络,系统全面地解析疾病发生发展的复杂机制,进而从整体上解释生物学问题。

分析思路
在这里插入图片描述
关联分析内容

  1. KEGG通路富集分析。
  2. 相关性热图。
  3. 相关性网络图。
  4. 典范对应分析(CCA analysis)。
  5. O2PLS模型关联分析。
  6. 鉴定关键LncRNA/mRNA/代谢物。
  • 0
    点赞
  • 2
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值