lincRNA和microRNA

最新推荐文章于 2022-05-10 14:28:37 发布
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分类专栏： 基因结构 文章标签： 基因
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本文链接：https://blog.csdn.net/m0_37119401/article/details/70344691
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原核细胞无内含子外显子之分，真核生物才具有。非编码RNA分为三类，包括microRNA和lincRNA等。microRNA通过互补配对使mRNA沉默或降解，而lincRNA主要通过与蛋白质结合调控基因表达。
摘要由CSDN通过智能技术生成
编码区是细胞DNA的一部分，我们知道， 基因分为：编码区， 非编码区。编码区是指能够转录 信使RNA的部分，它能够合成相应的蛋白质，而非编码区是不能够转录信使RNA的DNA结构。但是它能够调控
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lncRNA数据分析专题
庐州月光的博客
11-28 2078
欢迎关注”生信修炼手册”!lncRNA是一种长度在200bp以上的非编码RNA, 虽然没有编码蛋白的功能，但是却具有很重要的调控作用，可以在表观遗传水平，转录水平，转录后水平等多个层次调...
一文读懂长非编码RNA（lncRNA）的分类、功能及测序鉴定方法
AIPuFu的博客
10-18 1万+
RNA的重要调控功能发现历程（Rinn et al. Annu Rev Biochem, 2013） 长非编码RNA，英文名为long noncoding RNAs，缩写为lncRNA，是指长度大于200 核苷酸的非编码RNA。LncRNA因具有非常重要的调控功能，且几乎参与到了各种生物学过程和通路，与各种疾病的发生发展紧密关联，从而成为过去几年和将来的研究热点和重点。对于人类基因组来说，产生...
如何批量预测lncRNA靶向的miRNA？
weixin_46500027的博客
03-17 9408
lncRNA能够将miRNA吸附过来，相当于竞争性结合，不让miRNA对mRNA发挥作用，因此形成了lncRNA-miRNA-mRNA的调控网络，简称ceRNA。 在做生信分析时，我们通过数据库筛选了一些调控自己靶基因mRNA的lncRNA，可以使用很多网站预测lncRNA结合的miRNA。 那么问题来了，大部分网站通常都是输入一个lncRNA，预测与其结合miRNA。如果我们筛选到了几十个甚至几百个lncRNA，如何批量预测lncRNA靶向的miRNA。 我向大家推荐一个网站：mircode。
LncRNA与代谢组联合分析
aganlala的博客
01-22 668
LncRNA与代谢组联合分析 简介 长非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类长度大于200个核苷酸但不具备编码蛋白质能力的分子。普遍存在于人类和各种真核生物中，lncRNA具有广泛转录、种类众多、功能多样等特点，是多种生物学过程的必需调节剂，并通过多种机制起作用。代谢组是生物体在内外调控下基因转录的最终结果，是生物体表型的物质基础和表型的直接体现者。 在系统生物学研究时代，生物发育过程复杂多变，基因调控网络复杂，单独用一种组学对系统生物学进行研究，往往比较片面。lncRN
lncRNA是什么？
leroylee7的博客
12-07 6360
长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）在人类转录组中占到了相当大的比例。 大量lncRNA在肿瘤中特异性表达，并能对多种肿瘤生物学过程进行调控，这使得lncRNA在肿瘤治疗中表现出巨大的前景，围绕lncRNA展开的研究也是近年来的热门话题。 一、LncRNA简介 LncRNA是指一类长度超过200nt，不编码蛋白的RNA（有研究表明少数lncRNA可能具有编码微肽的能力）。 这类RNA起初被认为是基因组转录的“噪音”。...
miRNA与 lncRNA的相互调控作用
qq_37637914的博客
03-16 1万+
miRNA与 lncRNA的相互调控作用在肿瘤 中的研究进展miRNAlncRNAmiRNA与 IncRNA 的相互调控作用对肿瘤的影响 miRNA miRNA在肺癌、乳腺癌和前列腺癌等多种肿瘤中较正常组织存在差异性表达,其机制包括：miRNA定位于癌症相关的基因组区域 (CAGR)；miRNA表达的表观遗传调控；miRNA加工基因和蛋白质的发育异常。这些机制使 miRNA既可发挥诱癌作用 (例如：miR-21和 miR一345能引起转基因鼠模型肿瘤的发生)，又可抑制肿瘤发生 (例如：缺失miR-15a／1
lincRNA_pipeline:从TopHat输出到最终的lincRNA检测，优化lincRNA的流水线
05-12
本文档介绍了一个管道，该管道集成了多个Python脚本和linux命令，以根据TopHat-Cufflinks-Cuffcompare输出生成长的非编码RNA（lncRNA）。 使用注意事项 可以使用脚本lincRNA_pipeline.sh运行管道。 ./lincRNA_...
大数据-算法-基于多组织转录组数据的小鼠lincRNA的鉴定和功能分析.pdf
04-17
大数据-算法-基于多组织转录组数据的小鼠lincRNA的鉴定和功能分析.pdf
解剖人类lincRNA中表型变异的全球图谱。
03-16
综上所述，本研究代表了在lincRNA相关疾病机制和遗传学研究方面的一个重要进展，它不仅为研究者提供了丰富的数据资源，还为理解lincRNA在人类健康和疾病中的作用提供了新的理论基础。随着研究的进一步深入，我们有...
Linux进程状态(ps stat)之R、S、D、T、Z、X
学海无涯，回头是岸........
05-13 7759
一、进程的状态表述：#define TASK_RUNNING 0#define TASK_INTERRUPTIBLE 1#define TASK_UNINTERRUPTIBLE 2#define TASK_STOPPED 4#define TASK_TRACED 8/* in tsk->exit_state */#define EXIT_ZOMBIE 16#d
lncRNA数据库和miRNA数据库
lyn21418154的博客
10-26 1万+
lncＲNA- related database Noncoding ＲNA       http:/ /biobases. ibch.poznan．pl/ncＲNA/  fＲNAdb                    http:/ /www． ncrna．org/frnadb/  NＲED                      http:/ /jsm- research. imb.
总结实验室对转录组及lncRNA数据分析的思路
qq_41933915的博客
09-13 5913
     继师兄详细地讲述这个思路之后，我进行一个归纳总结（师兄说，首先要建立一个思想上的流程，再来纠结软件、命令这些细节！！！！！！）      首先你得了解 raw_data / 参考基因组  .fa / 注释文件 .gtf / 索引文件 indexes（通过hisat2-build ,根据基因组文件新建索引文件）      raw_data 原始数据      参考基因组  .fa  ...
分享miRNA和lncRNA靶向预测网站——miRcode，lncRNABase，starbase，RegRNA2.0
热门推荐
weixin_46500027的博客
04-12 1万+
lncRNA能够将miRNA吸附过来，相当于竞争性结合，不让miRNA对mRNA发挥作用，因此形成了lncRNA-miRNA-mRNA的调控网络，简称ceRNA。 在做生信分析时，我们通过数据库筛选了一些调控自己靶基因mRNA的lncRNA，可以使用很多网站预测lncRNA结合的miRNA。 先前向大家简单介绍过预测lncRNA和miRNA的方法: 如何批量预测lncRNA靶向的miRNA？_Lijingxian教你学生信的博客-CSDN博客_lncrna预测mirnalncRNA能够将miRNA吸附
android面试
snack23的博客
05-10 288
CSDN话题挑战赛第1期 活动详情地址：https://marketing.csdn.net/p/bb5081d88a77db8d6ef45bb7b6ef3d7f 参赛话题：Android面试宝典 话题描述： 现在CSDN、知乎、掘金上各路大佬层出不穷，他们身经百战、血洗杀场，总结出满满的求职干货。但同时也存在很多非良心的博主，要么活出了人类的本质，复读机一样到处转载；要么纯粹自嗨型草草说了自己的经验，让读者无法从良莠不齐的资源海洋中高效高质地获取真正有用的信息。本话题的目的很简单，一句话：用最少的时间，最
UVALive - 7818-MicroRNA Ranking
xbb0720的博客
07-30 499
题目链接：UVALive-7818-MicroRNA Ranking （一）题面： Problem description Ahlaam is a computer science student, doing her master thesis on a bioinformatics project about MicroRNAs, special molecule types foun...
LncBase:lncRNA与miRNA相互作用数据库
庐州月光的博客
01-10 6628
欢迎关注”生信修炼手册”!有非常多的文献报导指出，lncRNA可以作为miRNA sponge， 从而与miRNA发生相互作用。LncBase是一个专门记录lncRNA与miRNA相互作...
A. Gene
大贝贝壳的博客
03-03 155
枚举起始位置，然后向后面贪心匹配，因为T是S的子串，所以从前往后以此判断当前的T[i]是否等于当前的S[i],如果不等则直接加上T[i]的代价加入除了当前字符以外的字符是没有意义的，如果相等则下一个。 #include<bits/stdc++.h> using namespace std; const int maxn=10005; int dp[maxn][maxn/2]; in...
癌症基因组中lncRNA聚腺苷酸化全面图谱与预测模型
本文主要探讨了长非编码RNA (lincRNA) 在癌症基因组中的聚腺苷酸化 (polyadenylation) 全基因组鉴定和预测模型的重要性。lncRNAs 是一类在细胞调控中发挥关键作用的非编码RNA分子，它们通过RNA聚合酶II的转录过程被...
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