QPCR绝对定量实验(探针法)介绍
- 技术概述
实时荧光定量PCR(qPCR)探针法是一种高灵敏度、高特异性的核酸定量技术。本实验采用TaqMan探针法,通过探针上的荧光报告基团与淬灭基团分离释放荧光信号,实时监测PCR扩增进程,结合标准曲线对目标基因进行绝对定量,精确计算样本中核酸的拷贝数或浓度。该方法适用于低丰度靶标检测及严格定量需求的研究,如病原体载量分析、转基因成分定量等。
二、实验目的
通过构建标准曲线,利用探针法qPCR技术对目标基因(如病毒基因组、转基因序列、特定基因表达产物等)进行绝对定量,提供拷贝数或浓度的精准数据,为临床诊断、基因表达分析、食品安全检测及药物研发提供关键依据。
三、实验流程
1、DNA抽提
取约10mg样品至冷冻研钵中,加入液氮研磨至粉末状,转移至1.5mL离心管中,加200 uL缓冲液GA,振荡至彻底悬浮。然后,严格按照“TIANamp Bacteria DNA Kit”说明书步骤进行提取,详见说明书附件。
最终洗脱体积均为50uL。
2、定量PCR检测
1)将Mix在4℃下融解,轻柔地上下颠倒混匀并进行短暂离心。
2)冰上配制下表中的反应液
成分 | 加入量 | 终浓度 |
Premix Ex Taq(Probe qPCR)(2X) | 5μL | 1× |
Forward Primer (10μM) | 0.2μL | 0.2 μM |
Reverse Primer (10μM) | 0.2μL | 0.2 μM |
Probe(10μM) | 0.4μL | 0.4 μM |
ROX Reference Dye Ⅱ(50X) | 0.1μL | 0.5× |
DNA 模板 | 4.1 μL |
3)将反应管进行短暂离心,确保所有反应液在反应孔底部。
4)采用三步法程序进行反应:
循环数 | 步骤 | 温度 | 时间 |
1 | 预变性 | 95℃ | 20s |
40 | 变性 | 95℃ | 3s |
扩增 | 60℃ | 30s |
四、技术优势
✅ 高特异性:探针与靶序列特异性结合,避免非特异性扩增干扰
✅ 高灵敏度:可检测低至1拷贝/μL的靶标,适用于痕量样本
✅ 绝对定量:基于标准曲线提供精确拷贝数,数据可比性强
✅ 应用广泛:适用于血液、组织、细胞等多种样本类型
- 适用范围
1️⃣ 病原体载量检测(病毒、细菌、真菌)
2️⃣ 转基因生物(GMO)成分定量分析
3️⃣ 基因表达绝对定量(mRNA/miRNA)
4️⃣ 药物疗效评估(靶基因表达动态监测)
- 代表性实验