文献解读-肿瘤测序-第二十七期|《敲减通过控制TOP2A下调的NUSAP1可以抑制人胶质母细胞瘤的细胞增殖和侵袭》

最新推荐文章于 2024-08-08 13:26:18 发布

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分类专栏： Sentieon 文章标签：基因数据分析生信服务基因测序变异检测 Sentieon

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关键词：肿瘤测序；基因测序；变异检测；

文献简介

标题（英文）：Knockdown of NUSAP1 inhibits cell proliferation and invasion through downregulation of TOP2A in human glioblastoma
标题（中文）：敲减通过控制TOP2A下调的NUSAP1可以抑制人胶质母细胞瘤的细胞增殖和侵袭
发表期刊：Cell Cycle
作者单位：山东大学齐鲁医院等
发表年份：2022
文章地址：https://doi.org/10.1080/15384101.2022.2074199

图1 文献简介

多形性胶质母细胞瘤（GBM）是最恶性的原发性人脑肿瘤类型，其特征是增殖率高，预后不良，其中 5 年生存率仍然低于 5%。在过去的40年中，已经实施了多种治疗方式来提高生存率。然而，由于GBM的高侵入性，肿瘤组织不能通过手术完全切除，从而导致肿瘤复发。

核仁和纺锤体相关蛋白 1 （NUSAP1）是一种不可或缺的有丝分裂调节因子，据报道参与几种类型癌症的发展、进展和转移。

在本研究中，研究者研究了NUSAP1在人GBM中的表达和功能。研究者首先分析了公开数据库中的分子和临床数据，发现NUSAP1表达在GBM组织样本和GBM细胞系中显着上调。随后，在体外和体内模型中使用敲低策略来探索NUSAP1在GBM中的功能，并鉴定可能介导NUSAP1功能的共调控分子，例如拓扑异构酶2A（TOP2A）。该研究的研究结果为治疗GBM的新型靶向治疗提供了一种潜在的策略。

测序流程

样本转录组分析过程中，研究者使用Sentieon软件进行SNV和InDels检测分析。

图2 sentieon的作用

图3 NUSAP1表达在高级别胶质瘤中上调,并与胶质母细胞瘤患者预后呈负相关

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