介绍
常见的模型有两种,一种的预后模型,一种是诊断模型。简单来说就是,当研究的疾病与时间队列相关时,就可以构建预后模型,构建风险模型需要注意的是需要有样本的生存数据和生存状态。当研究的对象只有一个疾病发生与否的状态,或者是耐药与否的状态时,可以构建诊断模型。
如何做到零代码构建预后/诊断模型呢?
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1、如何构建风险预后模型
常见的方法,目前也是文章中用到比较多的方法,先通过单因素cox分析筛选预后相关的基因,然后通过lasso分析对基因数量进行压缩,筛选非共线性表达的基因,最后通过逐步回归的方法进一步压缩基因,最后通多因素cox分析构建模型。
这三步构建风险模型时目前最常用的方法之一,这三步的筛选是必须的,如何进行适当的调整呢?
首先单因素cox分析,使用p<0.05筛选预后相关的基因,当然这里的单因素cox分析是必须的,为什么?当然是为了最后构建模型高低风险组与预后相关,但是0.05的阈值并不是必须的,常用的阈值为0.05,0.01,0.005,0.001