医学专题--多组学在药物治疗靶点筛选中的研究思路

最新推荐文章于 2025-04-27 11:38:07 发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/bioyigene/article/details/133693358
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本文探讨了多组学大数据如何加速药物研发，通过三个案例展示了转录组、蛋白质组和代谢组等技术在治疗矽肺、急性髓系白血病和缺血性脑损伤中的应用，揭示了潜在的治疗靶点和机制。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

研究背景

药物靶点（drug target）：是指药物在体内的作用结合位点，包括基因位点、受体、酶、离子通路、核酸等生物大分子，靶向药物从单靶点药物到多靶点药物都在不断进行临床探索。小分子多靶点药物因其多靶向性、高效率性和安全性等优点，已成为近些年临床研究青睐的对象。自21世纪以来，基于靶点的药物发现模式逐渐取代了传统的基于药物化学结构的发现模式，成为现代创新药物研发的主流模式。

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通过多组学大数据整合分析，可以加速药物研究，可广泛地应用与病人的指导用药等领域。

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研究思路

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接下来，给大家分享几篇关于多组学技术在药物治疗靶点研究中的应用案例！！

案例一

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bioyigene
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《自然》杂志热点研究：人工智能在多组学和药物发现中的应用
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人工智能生物学分析算法是处理生物网络数据的有效方法，它构建机器或程序来模拟人类智能，从而在生物网络中实现分类、聚类和预测任务。在过去的几十年里，我们看到了人工智能生物学分析算法的快速发展。
cytoscape使用方法_单细胞聚类方法大比拼（III）
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嘿，大家好我又来了！回忆一下，在前两期的文章中我已经给大家介绍了常见的聚类如层次聚类、k-means等，以及为单细胞专门开发的SC3聚类。今天带来本系列的最后一个聚类方法——谱聚类(Spectral Clustering)的介绍。听这个名字大家可能会觉得很陌生，但是如果你有过单细胞的分析经历，可能会在无意中使用过它。没错，它就是大名鼎鼎的R包Seurat自带的默认聚类方法。单细胞聚类方法...
多组学在药物机制解析和诊断标志物开发中的应用
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基于深度学习的药物筛选与发现
weixin_42605076的博客
10-08 1657
基于深度学习的药物筛选与发现是利用深度学习模型自动化和加速药物开发过程的一个重要方向。传统的药物发现过程通常耗时长、成本高，需要大量的实验和计算，而深度学习通过从大规模生物医学数据中学习规律，能够帮助研究人员更快速地筛选潜在药物，并预测其在体内的行为。以下是基于深度学习的药物筛选与发现的关键技术与应用。
靶点药物筛选知多少？ - MedChemExpress
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02-29 1225
本文介绍了基于靶点的药物筛选策略，包括靶点类型和特点，以及提高筛选效率的方法。文中重点介绍了GPCR、激酶、离子通道和核受体四大类靶点，并提到了MCE药筛平台提供的基于靶点的药筛技术服务。这些技术可帮助全球科研客户及新药研发客户提高药物发现及研究效率。
一文读懂多组学联合分析产品在医学领域的应用
Magigene的博客
09-12 1190
本研究记录了一组匹配的正常衰老（NA）和非传染性疾病老年人的多模式脑电图（EEG）数据，并收集了他们的粪便样本和尿液外泌体，通过整合宏基因组学、蛋白质组学和代谢组学分析，确定非传染性疾病的多组学特征和代谢途径。我们的研究首次描述了血毒症发展过程中血清外泌体的分子动力学特征，并提出了一些假设的分子机制，为正在进行的脓毒症斗争提供有帮助的诊断和治疗见解。例如，通过分析患者的基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据，可以发现与特定疾病相关的特定分子标志物，从而提高诊断的准确性和敏感性。影响因子：46.297。
医学专题-多组学在疾病发生发展过程中的研究思路
bioyigene的博客
09-04 329
从疾病表型或某种生物现象出发，寻找影响疾病发生发展的关键因子或通路，借助高通量的技术手段，设置相应的患者组和健康组，通过转录组、蛋白质组或代谢组学分析，筛选差异表达基因、蛋白或差异代谢物。再针对这些通路或靶点，通过一系列的分子机制研究、功能验证等，对下游的调控网络进行研究，找到关键的调控机制。在本研究中，作者利用ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq进行综合多组学分析建立了一个肿瘤抑制因子模型，在该模型中，SETD2介导的H3K36me3缺失激活增强子，通过调节染色质可及性来驱动致癌转录输出。
入门到进阶 | 多组学技术结合的方法在生物医学研究中的应用
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审稿人看了直呼内行：多组学整合分析——科研小白进阶之路
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多组学，多平台分析解决方案
介绍一款|用于多组学整合和网络可视化分析的在线平台
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多组学数据整合助力癌症治疗靶点发现｜行业前沿·24-10-18
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国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟（CPTAC）提供了一个丰富、连贯且强大的蛋白质基因组学数据集，该数据集通过协调来自十种不同癌症类型（包括胶质母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、乳腺癌、胰腺导管腺癌、透明细胞肾细胞癌、高级别浆液性卵巢癌、子宫内膜癌和结直肠腺癌）的超过一千个肿瘤的多组学分析及临床数据生成[2]。所呈现的分析为高度过度表达/过度激活的蛋白质、激酶和蛋白质上的磷酸位点提供了有价值的信息，这些位点对于特定癌症类型来说是相似或独特的。
北京工业大学25计专上岸经验分享
qq_62271524的博客
04-27 735
本科就读于河北双非，专业为计算机科学与技术，四级三次498，六级两次460，拿过几次校级奖学金，竞赛经历有蓝桥杯国三、数学竞赛省二。本科成绩排名靠前，保研保7排8，遗憾选择考研继续研究生生涯，以下是我的初复试经验分享。
北京市城-郊梯度森林表土碳组分及其影响因素数据集（2019）
05-02
作者于2019年6月下旬至7月初，从北京市中心（紫禁城）到郊区设置了4条不同走向（东北、西北、西南和正南）的城—郊梯度样带；随机选取了20个独立的城市森林公园进行采样。每个公园选择3块典型森林斑块，采集表层（0-10 cm）和亚表层（10-20 cm）土壤样品，并测定了土壤总碳含量、土壤有机碳含量、颗粒态有机碳和矿物结合态有机碳含量。该数据集内容包括：（1）样点位置数据；（2）研究区森林表土总碳、总有机碳、总无机碳、颗粒态有机碳和矿物结合态有机碳含量；（3）森林表土碳组分含量与不同影响因素数据，包括：土壤数据（土壤pH、土壤粘粉粒含量）、植被数据（植被覆盖度、公园年龄、树种多样性）、气候数据（年均温、年降水量）。数据集存储为.shp和.xlsx格式，由8个数据文件组成，数据量为30.7 KB（压缩为1个文件，27 KB）。田越韩, 郭泓伯, 高晓飞等. 北京森林表土碳组分城郊梯度变化及其影响因素[J]. 地理学报, 2024, 79(1): 206-217. DOI: 10.11821/dlxb202401013.
USB转串口模块：CH340与FT232双选，61*35mm尺寸，原理图&PCB版
05-02
内容概要：本文详细介绍了集成CH340和FT232两款芯片的USB转串口模块的设计与应用。该模块尺寸为61x35mm，采用跳线帽进行芯片切换，支持多种接口（USB-A公头、Mini USB母座）和电源输出（5V和3.3V）。文中探讨了硬件配置、电源设计、信号切换电路以及PCB布局等方面的细节，并提供了Python、Arduino和Linux下的代码示例来展示不同场景下的使用方法。此外，还分享了一些实际项目中的经验和注意事项，如波特率适配、电磁兼容性和稳压电路设计等。 适合人群：从事嵌入式系统开发、硬件设计及相关领域的工程师和技术爱好者。 使用场景及目标：适用于需要灵活选择USB转串口芯片的项目，特别是在工业级应用场景中，能够提供稳定的通信解决方案。目标是帮助开发者更好地理解和利用这一模块，提高开发效率和产品质量。 其他说明：文中提到的双芯片设计方案不仅兼顾了成本效益，还能满足不同项目的特定需求。对于初学者来说，可以通过提供的代码示例快速上手；而对于资深工程师，则可以深入研究硬件设计细节，优化现有产品。
基于水平集进化的轮廓提取MATLAB代码实现及优化策略研究
05-02
内容概要：本文详细探讨了利用MATLAB实现水平集进化进行图像轮廓提取的方法。首先介绍了传统的水平集演化方法存在的问题，如频繁的重新初始化导致计算效率低下和分割精度波动。接着提出了一种改进方案，即在演化方程中引入正则化项来自适应地维护水平集的良好状态，从而避免了显式的重新初始化操作。此外，还讨论了曲率计算方法的优化以及参数选择的影响，并展示了改进前后算法性能的具体对比实验结果。 适合人群：从事图像处理、计算机视觉领域的研究人员和技术开发者，尤其是对水平集方法有一定了解并希望提高其实战应用效果的专业人士。 使用场景及目标：适用于需要精确分割图像中目标对象的应用场合，如医学影像分析（CT、MRI）、遥感图像处理等。主要目的是提升图像分割的速度和准确性，同时降低计算资源消耗。 其他说明：文中提供了多个MATLAB代码片段用于解释各个关键技术点，便于读者理解和实践。对于想要深入了解水平集演化的机制及其优化策略的人来说是非常有价值的参考资料。
MLP信息熵随深度增加的变化
05-02
MLP信息熵研究完整代码
西门子S7-200 PLC与触摸屏实现的恒压供水系统全套图纸程序：一拖二与一拖三配置的实践应用
05-02
内容概要：本文详细介绍了基于西门子S7-200 PLC的恒压供水系统的设计与实现。系统采用一拖二或一拖三模式，确保供水系统的可靠性。核心组件包括PLC、富士PID控制模块和ABB变频器，通过精确的压力控制和快速响应，实现了稳定的恒压供水。文中提供了详细的PLC程序示例，涵盖水泵启停控制、PID算法调用以及变频器频率调节等功能。此外，还展示了触摸屏界面设计，用于实时监控和操作。硬件配置方面，强调了柜体制作图纸的重要性和规范性，确保电气接线正确无误。调试过程中，作者分享了许多实用技巧，如PID参数整定、变频器设置和故障切换逻辑等。 适合人群：从事工业自动化领域的工程师和技术人员，尤其是对PLC编程和恒压供水系统感兴趣的读者。 使用场景及目标：适用于工业现场的恒压供水系统设计与实施，旨在提高供水系统的稳定性和可靠性，减少因设备故障导致的生产中断。 其他说明：本文不仅提供了完整的硬件配置和软件编程指导，还分享了丰富的实战经验和调试技巧，帮助读者更好地理解和应用相关技术。
恒压供水系统：西门子224xp PLC与ABB变频器一拖二（一对一变频）控制系统
05-02
内容概要：本文详细介绍了基于西门子224XP PLC和ABB ACS510变频器的一对一变频恒压供水系统的设计与实现。系统旨在保持管网压力恒定，确保用户在不同用水需求下获得稳定水压。硬件配置包括西门子S7-224XP PLC、ABB ACS510变频器以及昆仑通态触摸屏。系统采用双PID控制策略，分为低频段和高频段控制，以提高响应速度和稳定性。此外，通过合理的逻辑设计实现了变频器之间的无缝切换，确保压力波动最小。实际应用案例表明，该系统显著减少了压力波动，降低了能耗，提升了用户满意度。 适合人群：从事工业自动化领域的工程师和技术人员，特别是对PLC编程和变频器配置有一定经验的人群。 使用场景及目标：适用于需要恒压供水的高层建筑、住宅小区等场所，目标是实现高效的水资源管理和节能降耗。 其他说明：文中还分享了一些调试技巧和注意事项，如变频器参数配置、PID参数调整、模拟量输出切换逻辑等，有助于实际项目的顺利实施。
KepWare与HMI的OPC连接通信：解决老PLC与新触摸屏连接难题的案例程序
最新发布
05-02
内容概要：本文详细介绍了如何利用OPC技术和KepWare软件解决老PLC与新触摸屏之间的连接问题。首先解释了OPC的作用及其工作机制，接着阐述了KepWare作为OPC服务器的功能和配置方法，包括添加设备驱动、配置参数以及创建标签。随后展示了具体的案例程序，如配置Modbus TCP通道、定义标签并进行数据转换，以及在HMI端使用VB脚本、C#代码等实现与KepWare的连接和数据交互。此外，文中还提供了关于优化性能、处理常见错误和故障排查的方法，如调整超时时间、设置心跳检测机制等。 适合人群：从事工业自动化领域的工程师和技术人员，尤其是需要解决老旧设备与现代控制系统兼容性的相关人员。 使用场景及目标：适用于需要将传统PLC集成到现代化HMI系统的场合，旨在确保不同年代、不同品牌的工业设备能够稳定可靠地相互通信，提高生产效率和维护便利性。 其他说明：文中不仅提供了详细的理论讲解，还有丰富的实战经验和技巧分享，帮助读者快速掌握相关技能并在实际工作中应用。
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