COD论文笔记SAM2-UNet: Segment Anything 2 Makes Strong Encoder for Natural and Medical Image Segmen

2024年8月META团队在arXiv发布最新SAM2论文,稍早些时间其已经发布SAM2的项目代码。

目测SAM2作为backbone可以取得很好的效果,这个可以想一个创新点尽快实验。

这篇论文的主要动机、问题和创新点可以总结如下:

动机:

图像分割在视觉理解中扮演着至关重要的角色,应用广泛,涵盖自然图像和医学图像的多个领域。近年来,视觉基础模型(Vision Foundation Models,VFMs)在多个任务上取得了优异的性能,尤其是Segment Anything Model(SAM1)及其后继版本SAM2展示了强大的分割能力。然而,SAM2虽然具备先进的架构和大规模数据训练,但其生成的分割结果是类不可知的(class-agnostic),即没有提供手动提示时,SAM2不能很好地适应具体任务的需求。这限制了其在实际应用中的灵活性,尤其是在需要任务特定或类别特定分割的场景中。因此,论文的动机在于如何改进SAM2模型,使其在处理不同下游图像分割任务时更加灵活、适应性更强

现有方法的不足:

  1. 类不可知的分割结果:SAM2在没有提示输入时,生成的分割结果无法根据具体类别进行调整,难以适应特定任务。
  2. ViT编码器的局限性:虽然已有研究尝试将SAM转化为U形网络结构,但这些工作大多基于传统的ViT编码器,其平面结构缺乏对多尺度特征的有效捕捉,导致在更复杂的分割任务中表现不佳。
  3. 参数调优效率低:由于SAM2的 Hiera 骨干网络参数巨大(如Hiera-L有214M个参数),进行完整的参数调优对设备资源要求较高,尤其是在内存有限的设备上。

拟解决的问题:

论文旨在解决以下几个问题:

  1. 如何将 SAM2 模型适配到各种具体的图像分割任务中,包括自然图像和医学图像分割,如伪装物体检测、显著性物体检测、海洋动物分割、镜像检测以及息肉分割等任务。
  2. 如何在不影响性能的前提下提高模型的参数调优效率,使其能够在内存受限的设备上进行训练。
  3. 如何构建一个高效且易于扩展的统一框架,以应对多种分割任务。

主要贡献:

  1. 提出了SAM2-UNet框架:该框架使用 SAM2 的 Hiera 骨干作为编码器,并结合经典的U形解码器架构。通过引入适配器模块(Adapter),能够实现高效的参数微调(参数更适合特定任务)。
  2. 展示了SAM2-UNet在多个任务上的强大性能:在伪装物体检测、显著性物体检测、海洋动物分割、镜像检测和息肉分割任务上,SAM2-UNet在18个公开数据集上的实验结果表明,该模型在五个基准上都优于现有的专用最先进方法。
  3. 提出了参数高效的微调方法:通过在 Hiera 编码器中加入适配器模块,模型能够在参数冻结的情况下高效地进行微调,减少内存占用。
  4. 消除了一些不必要的组件:论文移除了不必要的组件,如内存注意力、提示编码器和内存编码器,使得模型更简洁和高效。

创新点:

  1. 结合了 SAM2 的 Hiera 骨干与经典 U-Net 结构:论文提出了通过引入 Hiera 骨干来增强 U 形网络的分割能力,特别是 Hiera 的层次结构能够捕捉多尺度特征,克服了 ViT 平面结构的限制。
  2. 参数微调的高效性:通过适配器的引入,避免了对整个 Hiera 骨干进行完整参数调优的问题,实现了内存高效的微调方式。
  3. 广泛适用性:模型不仅能处理自然图像,还能应用于医学图像分割,具备极高的任务扩展性。
  4. 简化的架构设计:通过删减不必要的组件,保持了 U-Net 的简洁性,确保模型易于理解和使用。

总结来说,论文的贡献和创新体现在将 SAM2 的基础模型转化为一个高效、可扩展的分割框架,解决了现有方法在类不可知性、ViT编码器的局限性和参数调优效率低等问题。

Introduction

论文的第一部分引言(Section 1 Introduction)主要介绍了图像分割任务的背景、现有挑战以及本研究的动机和贡献,内容总结如下:

1.1 图像分割的重要性

图像分割在计算机视觉中具有重要地位,是视觉理解的基础任务之一。通过将图像划分为有意义的区域,图像分割为自然图像和医学图像中的多个下游任务提供了支持,例如:

  • 伪装物体检测(Camouflaged Object Detection)
  • 显著性物体检测(Salient Object Detection)
  • 海洋动物分割(Marine Animal Segmentation)
  • 镜像检测(Mirror Detection)
  • 息肉分割(Polyp Segmentation)

这些任务分别应用于不同领域,但设计一个能统一处理多种分割任务的模型仍然是一个开放性挑战。

1.2 视觉基础模型的兴起

最近,视觉基础模型(Vision Foundation Models, VFMs)的发展为图像分割任务提供了新的可能性。这些模型在多个任务上取得了优异的性能,其中Segment Anything Model 1(SAM1)和后续的Segment Anything Model 2(SAM2)表现尤为突出。SAM2在SAM1的基础上改进,使用了更大的训练数据集和优化的架构设计,进一步提升了模型性能。

1.3 现有的局限性

虽然SAM2在通用任务上表现良好,但在特定的图像分割任务上仍然存在一些局限性:

  • SAM2的分割结果类不可知,即没有提供手动提示时,无法生成类别特定的分割结果。这种设计在许多需要类别特定或任务特定的分割任务中表现不足。
  • 因此,如何增强SAM2的适应性,并将其更好地应用于下游任务仍是一个亟待解决的研究问题。

1.4 现有改进方法

为了使SAM更好地适配下游任务,已有研究提出了多种方法:

  • 参数高效微调:通过引入适配器,能够在不进行完整参数调优的情况下,实现任务特定的微调。
  • 结合额外条件输入:如文本提示、上下文样本等,增强模型对不同任务的理解。

此外,受经典U-Net及其变种的启发,研究人员也尝试将SAM转化为U形架构,但由于SAM1中的ViT编码器结构过于简单,缺乏层次性,使得其在复杂任务中的表现受到限制。幸运的是,SAM2引入了层次化的Hiera骨干网络,为设计更强大的U形网络提供了新的可能性。

1.5 本文的贡献

基于上述背景,本文提出了SAM2-UNet,一个简单但有效的框架,专为各种图像分割任务设计。该方法的优点包括:

  • 简单性:SAM2-UNet采用了经典的U形编码器-解码器架构,结构简单且易于扩展。
  • 高效性:通过在编码器中插入适配器,实现了参数高效的微调,使模型能够在内存受限的设备上运行。
  • 有效性:本文的实验表明,SAM2-UNet在多个公开数据集上均优于现有最先进的方法,展示了其在伪装物体检测、显著性物体检测、海洋动物分割、镜像检测和息肉分割等任务中的优异性能。

总结

引言部分概述了图像分割的重要性、现有基础模型的潜力及其局限性,并提出了本文的研究目标,即通过提出SAM2-UNet,构建一个强大、简单、且适用于多种任务的分割框架。引言也为接下来的模型设计和实验铺垫了理论基础。

Method

论文的第二部分(Section 2 Method)详细介绍了SAM2-UNet模型的整体架构设计及其关键组件,主要包括编码器、解码器、接收域块(RFBs)、适配器和损失函数等内容。以下是对该部分的详细总结:

2.1 模型总体架构

在图中的 Hiera Block 中,fire logoice logo 的确可以表示模型中参数的状态:

  • Fire logo:表示参数可以微调,也就是这些部分的参数是可以训练的。在这张图中,fire logo 出现在 Adapter 模块 上,意味着适配器模块中的参数是可调整的。通过适配器,模型可以在不改变Hiera骨干网络大量预训练参数的情况下,进行高效的微调

  • Ice logo:表示参数是冻结的,即这些部分的参数在训练过程中不会更新。在图中,ice logo 出现在 Hiera Block 的核心模块(如 Attention 和 MLP)旁,意味着这些模块的参数是冻结的,通常保留使用预训练模型的权重,不进行进一步训练。

总结来说,fire logo 表示参数可以训练,ice logo 表示参数冻结不变。通过这种设计,SAM2-UNet 能够通过微调少量参数(适配器模块),在不同任务中实现性能的提升,而无需对整个大型预训练模型进行大规模的重新训练。这种方式有效地减少了计算资源的需求,同时保持了模型的强大表现力。
在这里插入图片描述

SAM2-UNet 是一个基于 U-Net 结构的分割模型。其编码器使用了来自 Segment Anything Model 2 (SAM2) 的Hiera 骨干网络,而解码器则采用了经典的 U 形设计。该模型的总体架构由四个主要组件组成:

  1. 编码器(Encoder)
  2. 解码器(Decoder)
  3. 接收域块(RFBs)(Receptive Field Blocks)
  4. 适配器(Adapters)

论文还展示了 SAM2-UNet 的简化示意图(如图 1 所示),描述了每个模块的具体功能及其在网络中的位置。

2.2 编码器

SAM2-UNet 的编码器采用了 SAM2 预训练的 Hiera 骨干网络。与 SAM1 中的 ViT 编码器不同,Hiera 具有层次化结构,更适合捕捉多尺度的特征,这对 U 形网络设计尤为关键。给定输入图像 I ∈ R 3 × H × W I \in R^{3 \times H \times W} IR3×H×W,其中 H H H W W W 分别代表图像的高度和宽度,Hiera 输出四个层次化的特征 X i ∈ R C i × H /

### Mamba-UNet 架构及其在医学图像分割中的应用 Mamba-UNet 是一种基于纯视觉模型的架构设计,专为医学图像分割任务而优化。它继承了 U-Net 的经典编码器-解码器结构,并通过引入创新性的模块来提升性能和效率。 #### 1. Mamba-UNet 的核心架构特点 Mamba-UNet 结合了 Vision Transformer 和卷积神经网络的优势,在保持高效计算的同时增强了特征提取能力。其主要特性如下: - **双流特征融合机制** Mamba-UNet 利用了多尺度特征图之间的交互作用,通过跨层连接实现更深层次的信息传递[^1]。这种设计显著提升了模型对复杂边界区域的理解能力。 - **轻量化注意力模块** 在传统 U-Net 基础上,Mamba-UNet 集成了高效的自注意力机制,用于捕捉全局上下文信息。这使得模型能够更好地处理具有较大形变的目标对象。 - **渐进式下采样策略** 不同于标准 U-Net 中固定的池化操作,Mamba-UNet 使用了一种动态调整步幅的方法来进行逐级降维。这种方法可以减少不必要的细节损失并保留更多语义信息。 #### 2. 应用场景与优势分析 Mamba-UNet 主要应用于医疗领域内的高精度图像分割任务,例如肿瘤检测、器官轮廓描绘以及细胞分类等。以下是该方法的一些具体应用场景及对应优点: - **脑部 MRI 图像分割** 对于大脑组织切片数据集而言,由于不同灰质白质区域之间存在模糊过渡带,因此需要极高分辨率才能区分细微差异。Mamba-UNet 凭借强大的局部感知能力和长距离依赖建模功能成功解决了这一难题。 - **肺结节 CT 扫描识别** 肺部影像通常伴有大量噪声干扰项,这对任何算法都构成了严峻挑战。然而借助精心设计的空间金字塔池化单元,再加上残差学习路径的支持,最终实现了稳健可靠的预测效果。 ```python import torch from torchvision import models class MambaUNet(torch.nn.Module): def __init__(self, num_classes=1): super(MambaUNet, self).__init__() # Encoder layers with progressive downsampling strategy self.encoder = [ torch.nn.Conv2d(3, 64, kernel_size=3, stride=1, padding=1), ... ] # Decoder layers incorporating lightweight attention modules self.decoder = [ torch.nn.ConvTranspose2d(128, 64, kernel_size=2, stride=2), ... ] self.final_conv = torch.nn.Conv2d(64, num_classes, kernel_size=1) def forward(self, x): skip_connections = [] for layer in self.encoder: x = layer(x) skip_connections.append(x) for i, layer in enumerate(self.decoder): x = layer(x) x += skip_connections[-i-1] output = self.final_conv(x) return output ``` 上述代码片段展示了如何构建一个简化版的 Mamba-UNet 模型框架。实际部署过程中可能还需要进一步调优参数配置以适应特定需求环境下的表现指标要求。 #### 总结 综上所述,Mamba-UNet 提供了一个灵活且有效的解决方案来应对现代医学成像技术所带来的各种新问题。凭借独特的体系结构改进措施,不仅提高了整体运行速度还兼顾到了准确性方面的要求。
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