🏃以下均为我个人在宏基因组学习过程中的笔记,参考性不大,参考链接很靠谱。🙋
有什么想找的请直接Ctrl + F (我写的很乱)😺
下面🏃这些链接是我在学习中的参考文章
https://www.jianshu.com/p/66ab14988a74
https://zhuanlan.zhihu.com/p/54080691
https://zhuanlan.zhihu.com/p/64607571
https://mp.weixin.qq.com/s/BHCs2Y97jXL-2kInlu49UA
分箱Binning-MetaBAT2
宏基因组分箱(Binning)是将宏基因组测序得到的混合了不同生物的序列或序列组装得到的contigs按物种分开归类的过程,类似下图。传统的单物种全基因组序列都是经纯培养之后,再进行全基因组de novo测序才获得的,但是环境中存在着大量的不可培养微生物,宏基因组分箱技术有助于获得不可培养微生物的全基因组序列,获得新物种的基因组序列和功能,预测未知物种的培养方法等等。
关联分析
即通过binning得到的bins(