可视化绘图技巧100篇基础篇(一)-棒棒图

本文详细介绍了在R语言中使用maftools和ggplot2库绘制棒棒糖图的过程,包括基础棒棒糖图、自定义点与线条、高亮注释以及多组、多值情况的绘制。此外,还提到了使用Excel和Tableau制作棒棒糖图的方法,并提供了相关代码和数据处理步骤。
摘要由CSDN通过智能技术生成

目录

前言

绘图工具

R语言

maftools画棒棒糖图 (Lollipop chart)

ggplot2绘制棒棒糖图

棒棒图和显著相关性散点图

EXCEL

Excel绘制“带有气泡的条形图、棒棒图、滑珠图”

Tableau

棒棒图样式

制作棒棒糖图表

GIF演示

 Python

知识拓展

R语言绘制棒棒糖图

基础棒棒糖图

自定义点与线条

高亮并添加注释

多组情况

多值情况

Excel中绘制4种基础形态条形图


前言

棒棒糖图,就是长得像棒棒糖一样的图(一句废话),和柱形图,散点图想要表达的意思是一致的,不过展示会更加好看一点,是点图geom_point()和堆叠图geom_segment()的组合

绘图工具

R语言

maftools画棒棒糖图 (Lollipop chart)

随着癌症基因组学的进步,突变注释格式(MAF)被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变体。 癌症基因组图谱项目对30多种不同的癌症进行了测序,每种癌症类型的样本量超过200种。由体细胞变体组成的结果数据以MAF格式形式存储。 只要数据采用MAF格式,该软件包就会尝试从TCGA源或任何内部研究中有效地汇总,分析,注释和可视化MAF文件.

使用前要先将文件转换为maf格式,对于VCF格式文件,可以使用vcf2maf进行格式转换.

maf文件

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