如何鉴定一段抗体序列的CDR区（CDR1、CDR2、CDR3）

愿武艺晴小朋友一定得每天都开心 

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如果有一批的抗体序列,可按下面的步骤来处理：

(1)可以先处理为fasta的格式（或者不处理手动粘贴）

>20B11

NIVLTQSPASLAVSLGQRATISCKASQSVDYDGDSYMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNLESGIPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQQSNEDPWTFGGGTKLEIK

(2)这里有3种方法：

方法一：NovoPro方法；特点是：一次输入一条蛋白序列；优点是很简洁的告诉我们CDR1&CDR2&CDR3的位置和序列信息，其中参考信息数据库推荐选：IMGT数据库

网址：抗体可变区CDR标注 - 在线工具 - 纽普生物 - NovoPro

方法二：IMGT分区（IMGT/V-QUEST)；它需要先拥有一个账号

方法三：NCBI的Ig blast；特点：它的datainput是输入DNA序列

(3)将信息统一整理到Excel表格中：

做成不同的列：Cd3_aa & Cd2_aa & Cd1_aa

(4)进行聚类的分析

【Reference】其间参考了这位博主的方法：

抗体分区 (zhihu.com)

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