LCWGS(5)在Linux服务器上安装Samtools

已于 2023-04-28 21:34:04 修改
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文章标签： linux conda 运维
于 2023-04-28 21:33:50 首次发布
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本文介绍了非root用户如何在Linux服务器上通过conda环境安装Samtools，一个用于处理高通量测序数据的工具。详细步骤包括进入conda环境和输入安装命令，最后验证安装成功。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Samtools是一套用于处理高通量测序数据的程序。它由三个独立的仓库组成：Samtools，BCFtools 和 HTSlib。

官网：http://www.htslib.org/

由于我是非root用户，没有权限通过编译进行安装，因此这里介绍如何通过conda 环境进行安装samtools。

1. 进入conda环境

新建或进入已有的conda环境，这里我使用如下命令，进入自己的conda base环境

conda activate

2. 安装samtools

输入如下代码进行安装，中途输入y确认继续安装

conda install -c bioconda samtools

 等待安装完成后，输入samtools，出现如下内容表示安装成功。

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Junbo_Just_Jia
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