GO富集分析及可视化

GO是Gene Ontology的简称，是基因功能国际标准分类体系。它旨在建立一个适用于各种物种的，对基因和蛋白质功能进行限定和描述的，并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标准。GO分为分子功能（Molecular Function）、生物过程（Biological Process）、和细胞组成（Cellular Component）三个部分。

富集分析主要用于差异基因在GO term的富集程度。

GO term分为三大类，每一类从不同的层面解释基因的生物学功能，我们可以结合生物学问题的特殊性，有针对性的关注GO term。

GO富集分析的统计假设，并不能完全代基因功能的重要程度。要结合生物学问题、结合基因的功能注释，才能判断其中的基因变化是否有重要的生物学意义。

今天我们介绍我们在paper中经常看到的GO分析及可视化。（使用clusterProfiler包）。

代码如下：

第一步安装r包，对于3.6及以上的r的包安装方式参考（用高版本的R的人注意了）

 

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