circRNA相互作用预测数据库CSCD2

最近 CSCD 更新了2.0 的版本:CSCD2.0

0 (1).png

相比较之前的版本, CSCD2 主要是增加了分析的数据量。在 2.0 版本当中,作者从 ENCODE 和 SRA 数据库中收集了来自组织或细胞系的 1113 个样本的 RNA-Seq 数据集,包括 ==472 个癌组织样本、353 个正常组织样本、91 个癌细胞系样本和 197 个正常细胞系样本==。

0.png

功能方面的话,和之前版本没有多大的区别,主要也是用来预测 circRNA 和 miRNA/RBP 的相互作用。但是在数据查询方面的, 1.0的版本只提供了基于 circRNA 的查询。在 2.0 版本当中,则可以基于 miRNA/RBP 来进行查询。

0 (2).png

最后在 2.0 当中也提供了数据下载的功能。有兴趣 DIY 的可以直接下载原始数据。

文章剩余内容<<<<

  • 0
    点赞
  • 2
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值