fsl处理DTI数据流程

1.

IM_0025  output_bvals  output_bvecs  output_info.txt  output.nii

fslroi output b0 0 1

b0.nii.gz  IM_0025  output_bvals  output_bvecs  output_info.txt  output.nii

2.

bet2 b0.nii.gz nodif_brain -m -f 0.2

nodif_brain.nii.gz  nodif_brain_mask.nii.gz    b0.nii.gz   IM_0025   output_bvals   output_bvecs  output_info.txt  output.nii

3.

eddy_correct output data 0

b0.nii.gz    data.nii.gz  nodif_brain_mask.nii.gz  output_bvals  output_info.txt
data.ecclog  IM_0025      nodif_brain.nii.gz       output_bvecs  output.nii

4.

dtifit --data=data.nii.gz --out=data --mask=nodif_brain_mask.nii.gz --bvecs=output_bvecs --bvals=output_bvals

b0.nii.gz            data_L2.nii.gz      data.nii.gz       data_V3.nii.gz           output_bvals
data.ecclog      data_L3.nii.gz    data_S0.nii.gz      IM_0025                  output_bvecs
data_FA.nii.gz   data_MD.nii.gz    data_V1.nii.gz     nodif_brain_mask.nii.gz    output_info.txt
data_L1.nii.gz   data_MO.nii.gz    data_V2.nii.gz     nodif_brain.nii.gz         output.nii