Py之minepy:minepy的简介、安装、使用方法之详细攻略
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minepy的简介
minepy为基于最大信息的非参数勘探(MIC和MINE族)提供了一个库。主要特点:
- APPROX-MIC(原算法:DOI: 10.1126/science.1205438)和MIC_e (DOI: arXiv:1505.02213和DOI: arXiv:1505.02214);
- 总信息系数(TIC, DOI: arXiv:1505.02213)和广义平均信息系数(GMIC, DOI: arXiv:1308.5712);
- 一个ANSI C库
- 一个c++接口;
- 一个高效的Python API (python2和python3兼容);
- 一个高效的MATLAB/OCTAVE API;
minepy是一个开源的,gplv3许可的软件。minerva R接口在CRAN可用。
1、MICtools
“mine”命令行应用程序在1.2.2版之后就被弃用了。我们建议使用MICtools,这是一种全面而有效的用于TICe和MICe分析的管道。TICe被用于对所有可能的两两关系进行高效筛选,评估其重要性,而MICe被用于根据其强度对重要关联的子集进行排序。纸张、代码和文档。
minepy的安装
pip install minepy
pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple minepy