生信文献｜SEACells·推断转录和表观基因组细胞状态

metacell:不同细胞状态的细胞群，代表了高度细化、不同的细胞状态，其中元细胞内的变异是由于技术因素而非生物因素引起的（Genome Biol. 2019, 20, 206.）。

单细胞细胞状态聚合（SEACells），这是一种基于图的算法，使用核原型分析来计算metacells。证明了SEACells 能够提供对scRNA-seq细胞状态的稳健、全面的特征描述，并且成功地描述了染色质细胞状态，其分辨率能够推断基因表达底层的调控元素。

SEACells识别表型多样性中的元细胞

SEACells的metacells代表准确且稳健的细胞状态 

SEACells 用于基因调控推理 

SEACells 促进单细胞数据整合 

参考：Nature Biotechnology volume 41, pages1746–1757 (2023)