单细胞数据处理Seurat的按照特定Cluster或Cluster消除

最新推荐文章于 2024-04-20 14:50:47 发布

lowland12138

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分类专栏： R语言生物数据处理文章标签： r语言

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Seurat Object Cluster划分绘图

如果需要设置新的cluster或者去除原来cluster的划分可以尝试下面的代码
去除原来的cluster,将所有level设为0

#添加新的factor或者新的分类标准，此处希望能解开原来cluster的划分，使之成为一个整体level
data@meta.data$cluster<-factor(0)
#设定组分的分类标准
data<-SetIdent(data,value=data@meta.data$cluster)
VlnPlot(object = data, features = c("nFeature_RNA", "nCount_RNA"), ncol = 2)

实现前：
有分类