本文来自hiblup的官方使用手册的翻译性内容,仅做学习用途(https://www.hiblup.com/tutorials)
HIBLUP 是什么
HIBLUP是一个用户友好的软件,它通过最大限度地利用来自家系、基因组和表型的信息,以及所有与过程相关的函数,如关系矩阵的构建、性状的方差分量(遗传力)估计和使用各种算法的性状之间的协方差分量(遗传相关) ,混合模型的解,SNP 效应的计算和基因组交配的实施,提供每个个体的估计遗传价值。用户可以很容易地实现单性状模型、重复性状模型和多性状模型的简单线性模型(LM)、最佳线性无偏预测器(BLUP)、基于家系的 BLUP (PBLUP)、基因组 BLUP (GBLUP)和单步 GBLUP (SSGBLUP)。根据用户反馈,HIBLUP 的功能将不断丰富。
在哪里下载 HIBLUP
不同平台的 HIBLUP 最新发布的可执行文件可从以下网址下载:https://www.hiblup.com/download
学术上是免费的,商业使用,请联系开发团队。
如何引用 HIBLUP
For the HIBLUP Software, please cite:
Lilin Yin#, Haohao Zhang#, Zhenshuang Tang, Dong Yin, Yuhua Fu, Xiaohui Yuan, Xinyun Li*, Xiaolei Liu*, Shuhong Zhao*. “HIBLUP: an integration of statistical models on the BLUP framework for efficient genetic evaluation using big genomic data” Nucleic Acids Research (2023): gkad074.
For genomic mating, please cite:
Zhenshuang# Tang, Lilin Yin#, Dong Yin, Haohao Zhang, Yuhua Fu, Guangliang Zhou, Yunxiang Zhao, Zhiquan Wang, Xiaolei Liu*, Xinyun Li*, Shuhong Zhao*. “Development and application of an efficient genomic mating method to maximize the production performances of three-way crossbred pigs.” Briefings in Bioinformatics 24.1 (2023): bbac587.
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