Hiblup软件学习1

最新推荐文章于 2024-08-21 23:32:17 发布

爱刷短视频的大朋友

最新推荐文章于 2024-08-21 23:32:17 发布

阅读量642

点赞数 6

分类专栏： Hiblup 文章标签：学习

本文链接：https://blog.csdn.net/sweet_yemen/article/details/135831543

版权

Hiblup 专栏收录该内容

3 篇文章 3 订阅

订阅专栏

本文介绍了HIBLUP，一个用户友好的软件，支持多种遗传模型，用于利用大量基因组数据进行遗传评估。文章详细讲解了其功能、下载方式和引用格式，强调了HIBLUP在遗传性能优化中的应用。

摘要由CSDN通过智能技术生成

本文来自hiblup的官方使用手册的翻译性内容，仅做学习用途（https://www.hiblup.com/tutorials）

HIBLUP 是什么

HIBLUP是一个用户友好的软件，它通过最大限度地利用来自家系、基因组和表型的信息，以及所有与过程相关的函数，如关系矩阵的构建、性状的方差分量(遗传力)估计和使用各种算法的性状之间的协方差分量(遗传相关) ，混合模型的解，SNP 效应的计算和基因组交配的实施，提供每个个体的估计遗传价值。用户可以很容易地实现单性状模型、重复性状模型和多性状模型的简单线性模型(LM)、最佳线性无偏预测器(BLUP)、基于家系的 BLUP (PBLUP)、基因组 BLUP (GBLUP)和单步 GBLUP (SSGBLUP)。根据用户反馈，HIBLUP 的功能将不断丰富。

在哪里下载 HIBLUP

不同平台的 HIBLUP 最新发布的可执行文件可从以下网址下载:https://www.hiblup.com/download
学术上是免费的，商业使用，请联系开发团队。

如何引用 HIBLUP

For the HIBLUP Software, please cite:
Lilin Yin#, Haohao Zhang#, Zhenshuang Tang, Dong Yin, Yuhua Fu, Xiaohui Yuan, Xinyun Li*, Xiaolei Liu*, Shuhong Zhao*. “HIBLUP: an integration of statistical models on the BLUP framework for efficient genetic evaluation using big genomic data” Nucleic Acids Research (2023): gkad074.

For genomic mating, please cite:
Zhenshuang# Tang, Lilin Yin#, Dong Yin, Haohao Zhang, Yuhua Fu, Guangliang Zhou, Yunxiang Zhao, Zhiquan Wang, Xiaolei Liu*, Xinyun Li*, Shuhong Zhao*. “Development and application of an efficient genomic mating method to maximize the production performances of three-way crossbred pigs.” Briefings in Bioinformatics 24.1 (2023): bbac587.