- 背景介绍
- 4个层次的组学技术
- 代谢物可以反馈调节上游
- 文章发表现状
- 代谢物定义:分子量小于1000的小分子
- 代谢组学:检测生物体内的小于1000分子量的代谢物进行定性定量分析
- 检测方式
- 色谱技术-物质分离
- GC:气相色谱
- LC:液相色谱
- 质谱技术-物质鉴定
- 当遇到分子量相同的物质会打碎分子,进行二级质谱
- 色质联用
- 色谱技术-物质分离
- 仪器平台
- 公司选择
- 平台比较
- 代谢组研究流程
- 研究流程图
- 应用方向
- 农学
- 生长发育、胁迫响应、 免疫互作、突变表型 营养成分、活性物质
- 农学
- 代谢组的挑战
- 问题
- 为什么我的结果里只有400多种物质,还有很多物质没有写具体名字是什么?
- 数据库不够健全
- 尚未命名的物质
- 非靶向代谢组检测一般在400~700种物质
- 样品取样周期比较长,可不可以分批送样分批测?
- 不行,分批送样容易出现误差,假阳性
- 我之前有12个样LC-QTOF的非靶数据,现在又做了24个LC-QTOF的非靶,能放一起做差异分析吗?
- 不行,同2问题
- 在别的公司做了代谢项目,但是鉴定的物质太少了,能不能在BMK重新分析,多鉴定点代谢物?
- 看下是LC还是GC分析
- 公司之间数据库和分析水平相近,没有太大必要
- 代谢组不提供原始数据(谱图)
- 为什么我的结果里只有400多种物质,还有很多物质没有写具体名字是什么?
- 对未知物的鉴定,数据库不完善;
- 代谢物理化性质差别大,难以一次性提取、一次性检测;
- 多平台数据整合,同一物质在不同平台上谱图有差异;
- 研发出可供查询的标准数据库,就像GenBank的基因组资源;
- 代谢组学与其他组学数据的整合,多组学深入关联
- 问题
- 4个层次的组学技术
- 产品分类
- 非靶向代谢组学:种类多
- 普通非靶标
- 非靶向 代谢组是通过对样品中所有离子峰的采集,最大程度反映生命体对外界刺激、病理生理变化、 以及本身基因突变而产生的体内代谢物水平的多元动态反应。非靶能够定性到几百个初级代谢物。
- 适用客户:
- 没有明确的研究目标,希望比较样品中代谢物的差异,缩小研究范围
- 转录组+代谢组联合分析锁定关键通路中的基因和代谢物
- 希望检测数量较多的物质,能够覆盖大部分种类的物质
- 初级代谢物
- 相对定量
- 顶空进样非靶标
- • 挥发性有机化合物(VOCs, Volatile organic compounds)通常是指常压下,沸点在50℃-260℃的各种有 机化合物。研究表明,VOCs与人体神经系统发育、肝脏毒性、血液系统等方面有重大关系。
- 研究气味、芳香,挥发性化合物,比如酿酒、瓜果芳香
- 相对定量
- 与GC的区别:顶空进样是气体进样,GC是液体进样
- 脂质组非靶标
- 脂质包括脂肪酸及其天然发生的衍生物(酯或胺),以及与其生物合成、功能相关的化合物。主要分为 八大类:脂肪酸类、甘油酯类、甘油磷脂类、鞘脂类、固醇脂类、孕烯醇酮脂类、糖脂类、多聚乙烯类。
- 专门研究脂质,希望检测样品中各种脂质的差异
- 相对定量
- 肠道菌群非靶标
- 普通非靶标
- 靶标代谢组学:精准
- 针对特定的代谢物进行绝对定量,检测各个样品种某种代谢的含量。需要通过标准品建立预实验方案 以及检测方案,并利用标准品建立标准曲线实现绝对定量。
- 适用客户:
- 有明确的研究物质(20个以内)
- 样品数20个以上
- 绝对定量
- 高通量靶标——基因芯片
- 动物高通量靶标(重点学习)
- 定位:针对人、鼠、家畜、水产建立的动物代谢物数据库,包含初级代谢物和部分次级代谢物,1500种+物质。
- 适用客户:
- 动科院、水产院、兽医院、医学研究
- 样品数量6个以上
- 相对定量
- 畜禽经济性状与营养代谢(肉、蛋、奶)
- 动物疾病诊断和预防
- 药效评价 生物学重复:细胞 n≥3 动物样本 6-10 p 动物医学模型
- 植物高通量靶标
- 花青素kit
- 氨基酸kit
- 短链脂肪酸kit
- 游离脂肪酸kit
- 胆汁酸kit
- 动物高通量靶标(重点学习)
- 非靶向代谢组学:种类多
- 方案设计
- 代谢组
- 代谢组+转录组+qRT-PCR
- 代谢组+肠道微生物
- 代谢组+转录组
- 代谢组+微生物多样性
- 竞争优势
- 色谱设备:UPLC I Class
- 分析速度是 HPLC 的 8 倍,灵敏度是 HPLC 的 5 倍,并且同时提高分离度。
- 质谱设备:ACQUITY UPLC I Class
- ✔ 分离度:搭配亚2μm UPLC色谱柱,具有卓越的分离度。
- ✔ 稳定性:UPLC作为最佳质谱接口,可以极大限度的减少基质抑制效应, 保证长久的稳定性及重现性。
- ✔ 质量精度:独家专利LockSpray实时在线矫正技术,保证所获数据具有极 高的质量精度。
- ✔ 动态范围:QuanTof技术可以获得超过6个数量级的动态范围。
- ✔ 分辨率:在快速的扫描速率下,依然保持极高的分辨率,足以兼容UPLC 的分析速度。
- ✔ 灵敏度:StepWave 技术,保证满足痕量检测的要求。
- 色谱设备:UPLC I Class
- 个人总结
- 代谢水平的差异比转录水平差异更大,所以动物需要8个重复样本以上
- GC、LC不是二选一,初步分析范围较广推荐联用,确定分析某个成分可以选择其中一个
- LC检测更广泛一些
- 梳理客户
- 动/植物
- 上游基因定位/下游功能验证
- 代谢物的标准数据库目前还不完善
- 初级代谢物:微生物通过代谢活动所产生的、自身生长和繁殖所必需的物质,如氨基酸、核苷酸、多糖、脂类、维生素等。
- 检验的代谢物不一定是真正反映性状变化
- 靶标代谢组需要与部门联系,确定物质能否鉴定
- 动物高通量靶标可以鉴定1500+代谢物
- kit代表绝对定量
- 销售注意
- 根据自己的市场,可以主推哪些产品
- 普通非靶标
- 靶标代谢组
- 动物高通量靶标
- 多组学方案
- 推荐代谢组+转录组
- 竞争优势
- 设备先进
- 根据自己的市场,可以主推哪些产品
- 研究热点
代谢组测序产品概述
最新推荐文章于 2024-05-13 09:40:14 发布