NCBI中SRA数据库简介

NCBI中SRA数据库简介

SRA数据库简介

SRA 数据库， 为Sequence Read Archive 的缩写。主要存储高通量测序的数据，来自四个测序平台，分别为： Roche_LS454，Illumina，ABI_SOLID和HELICOS。

SRA 数据库的组织架构 

首先是项目编号，通常以PRJ开头，会记录该项目的一些背景信息，包括，研究的目的及意义，项目启动日期，作者单位信息等等，项目下面可以包含以下子内容： 

(1)研究内容(study)。 在 SRA 数据库中， 研究课题的检索号(accession number)以前缀 DRP， ERP 或S R P 开头。  

(2)样本信息(sample)。 样本的检索号以前缀 DRS， ERS 或 SRS开头。 样本信息可以包括物种信息、 菌株(品系)信息、 家系信息、 表型数据、 临床数据， 组织类型等。 

(3)实验信息(experiment)。实验的检索号以前缀DRX， ERX 或 SRX 开头。 

(4) 数据信息，包括序列及其质量信息等， 在 SRA 数据库中以run 为单元存储。 run 的检索号以前缀 DRR， ERR 或SRR 开头。  

SRA 数据库进入方法：在NCBI主页找到SRA就可以直接搜索了： National Center for Biotechnology Information    

更多SRA数据下载： 从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据 - 组学大讲堂问答社区 

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