Chimera 嵌合体

嵌合体序列由来自两条或者多条模板链的序列组成，示意图如下：

 

在PCR反应中，在延伸阶段，由于不完全延伸，就会导致嵌合体序列的出现，以上图为例，

在扩增序列X的过程中，在序列延伸阶段，只产生了部分X序列延伸阶段就结束了，在下一轮的PCR反应中，这部分序列作为序列Y的引物接着延伸，扩增就会形成X和Y的嵌合体序列；

在放一张具体一点的示意图，不完全延伸产生的序列作为下一轮PCR反应的产物，进行延伸

在PCR过程中，大概有1%的几率会出现嵌合体序列，所以在16S 扩增子测序的分析中，需要去除嵌合体序列

参考资料：http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html