嵌合体(chirmas)是指一个PCR产物来自2个甚至更多模板分子,产生的原因被认为是延伸未完全导致的(chimeras might be created due to incomplete extension,参考文献:Reducing chimera formation during PCR amplification to ensure accurate genotyping)。尤其是在模板分子高度相似的情况下,嵌合体比例会升高许多。其形成的原理图基本如下图所示:
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另外,在illumina平台上做高通量测序的时候,也有可能因为正反向两条模版在做桥式PCR的时候,形成嵌合体,从而导致产出错误数据。
因此,对于经过了PCR扩增产物文库测序数据,都必须进行去除嵌合体操作。这样获得的数据准确度会明显提高。
常见使用的去除嵌合体软件包括Usearch,Vsearch等。
NGS测序嵌合体是个需要去除的错误扩增序列
最新推荐文章于 2024-04-23 07:02:46 发布