snRNA-seq和scRNA-seq的区别和联系

最新推荐文章于 2024-08-09 11:48:35 发布
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分类专栏： 生信数据 学习资源 数据分析 文章标签： 生物信息
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各种RNAseq原理
weixin_30814329的博客
04-19 3570
RNA Sequencing Methods Low-Level RNA Detection CEL-Seq CirSeq CLaP CytoSeq Digital RNA Sequencing DP-Seq Drop-Seq Hi-SCL InDrop MARS-Seq Nuc-Seq PAIR Quartz-Seq scM&T...
Nature|单细胞核测序技术揭示心肌病转录图谱
悟道西方
01-09 1114
大家好，我是否认冶游史。今天给大家分享一篇发表在Nature上的非肿瘤文章，题目为：“Single-nucleusprofilingof humandilated andhypertrophic cardiomyopathy”--人类扩张型和肥厚型心肌病的单细胞核转录图谱。单细胞测序大家并不陌生，而单细胞核测序又有什么特点呢？我们一起来学习一下吧！1研究背景单细胞测序（scRNA-seq...
RNA-seq与scRNA-seq数据的联合分析方法（bulk与单细胞数据联合分析）
qq_36711935的博客
03-07 1757
RNA-seq与scRNA-seq数据的联合分析方法（bulk与单细胞数据联合分析）
RNA-seq技术原理
weixin_59289660的博客
03-19 6127
参考： 【陈巍学基因】RNA-seq - 知乎 一、基本原理 去除rRNA、tRNA等干扰，因此利用高等生物的mRNA都有Poly(A)尾巴这个特点，用带有Poly(T)探针的磁珠与总RNA进行杂交。然后Poly(T)探针就和带Poly(A)尾巴的mRNA结合在一起，接下来就回收磁珠，然后把这些带Poly(A)的mRNA从磁珠上洗脱下来。 第6步在cDNA两端加上A序列，再加上Y型序列，就成了标准的测序文库，这个标准的测序文库就可以拿到HiSeq测序仪上进行测序了。其中第4部得到的能够比对到基.
scRNA-seq Course 学习
Seraph09的博客
07-07 6272
昨天和今天都在学习scRNA-seq测序的教程。 scRNA-seq是对单个细胞进行测序分析，便于研究细胞的异质性。 scRNA-seq和bulk-RNA-seq相似，区别只在于研究的细胞数量，后者是对同一组织的大量细胞进行转录组的分析，而前者是对单个细胞进行转录组分析。 scRNA-seq的流程是制备单细胞，单细胞水平测序，数据分析。 昨天看到了分离单细胞和测序平台的方法上。 在分离单细胞方法有mirco-well plate、micro-fluid seq, droplet seq，分别是让细胞在微板上
snRNA-seq vs scRNA-seq谁更nice，用数据说话
SHANGHAILINGEN的博客
05-06 1077
snRNA、scRNA傻傻分不清的时候，人家已经开始择优了，如今的单细胞有当年高通量测序之势，势不可挡
scRNA-seq 数据处理流程
jiangshandaiyou的博客
11-23 397
scRNA
autoCell：用于scRNA-seq的分析工具
白景屹的博客
01-10 624
动机：scRNA-seq使研究人员能够以单细胞分辨率研究基因表达。然而，由dropout引起的噪声可能会妨碍精确的数据分析。迫切需要开发可扩展的去噪方法来处理庞大但稀疏的scRNA-seq数据。方法：在这里，作者提出了autoCell：一种用于scRNA-seq插补和特征提取的高斯混合变分自动编码器网络。autoCell为大规模scRNA-seq或snRNA-seq数据的端到端分析提供了深度学习工具箱，包括可视化、聚类、插补和疾病特异性基因网络识别。结果。
Adv Sci | scRNA+scATAC-seq解析植物根渗透胁迫的机制
Igenebook的博客
08-09 944
目前单细胞技术发展迅速，单细胞RNA-seq和单细胞ATAC已经应用到多个物种，植物中的多组学应用还相对较少，今天我们分享一篇单细胞ATAC+RNA-seq的文献，是由河北农业大学赵建军团队在国际知名期刊Advanced Science（中科院一区，IF：15.1）在线发表题为“Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cel
10xPilot_snRNAseq-human:10x用于v3生成数据的snRNA-seq的人类飞行员； 5个大脑区域
04-27
10xPilot_snRNAseq-人类 如何引用 学习规划 去做 交互式浏览数据 我们提供了5个交互式网站，可让您以单个核分辨率浏览每个大脑区域的数据。 这些交互式网站由提供 ，可让您添加，隐藏，自定义面板以可视化数据。...
snRNA_seq
03-10
"snRNA_seq"是一种生物学研究方法，主要用于分析细胞内的小核RNA（small nuclear RNA，简称snRNA）。snRNA是一类重要的非编码RNA分子，在细胞核内参与RNA剪接、mRNA稳定性和其他核内转录后修饰过程。通过snRNA测序...
系统整理scRNA与snRNA的区别和空转寻找“hotspot”
weixin_53637133的博客
05-29 972
系统整理scRNA与snRNA的区别和空转寻找“hotspot”
Word中数据的计算.pdf
10-11
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Microsoft Project Portfolio Server 2007 Datasheet_CN_Final.doc
10-11
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JaroWinklerSimilarity
10-11
Jaro-Winkler 相似度（Jaro-Winkler Similarity）是一种用于衡量两个字符串相似度的算法，特别适用于比较短字符串或需要考虑字符顺序的情况。它在信息检索、数据清洗和拼写校正等领域广泛应用。 主要特点 基本原理： Jaro-Winkler 相似度基于 Jaro 距离，这一距离主要考虑字符的匹配和顺序。 该算法首先计算两个字符串的匹配字符和匹配位置，以此计算相似度。 加权机制： Jaro-Winkler 在 Jaro 的基础上增加了对前缀匹配的奖励，这意味着如果两个字符串的开头部分相同，算法将给予更高的相似度评分。 结果范围： 相似度的值在 0 到 1 之间，1 表示完全相同，0 表示完全不同。
神经网络模型来检测肺炎的CT的影像
最新发布
10-11
神经网络模型来检测肺炎的CT的影像
20241011-0909
10-11
ffff
BitTorrent协议基础
10-11
DHT,TRACKER
rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA和microRNA分别指什么？
09-25
### 回答1： rRNA是核糖体RNA，是构成细胞核糖体的主要组成部分之一，参与蛋白质合成的过程。 tRNA是转运RNA，其主要作用是将氨基酸转运到正在合成蛋白质的核糖体上。 snRNA是小核RNA，是构成小核核糖核蛋白复合体（snRNP）的主要组成部分之一，参与基因的剪接作用。 snoRNA是小核仁RNA，是核仁中的一种RNA分子，与核糖体RNA结合形成核糖体前体粒子，参与核糖体的生物合成过程。 microRNA是微小RNA，是一种长度约为20-25个核苷酸的RNA分子，能够在细胞内调节基因表达，参与调控生物体的生长发育、免疫应答等生物学过程。 ### 回答2： rRNA代表核糖体RNA，是一种存在于细胞核和核仁中的RNA分子。它是合成蛋白质过程中不可或缺的组成部分，能够与蛋白质合成机器相结合，形成核糖体的主体结构。 tRNA代表转运RNA，是一种短小的RNA分子。它在蛋白质合成中起着重要的角色，能够将氨基酸运输到正在合成蛋白质的核糖体上。 snRNA代表小核RNA，是核糖体的一部分。它在前体mRNA的剪接过程中起着关键作用，可以帮助剪接酶识别剪接位点，确保正确的剪接产物的生成。 snoRNA代表小核仁RNA，主要存在于核仁中。它在修饰rRNA和snRNA上发挥重要作用，能够将化学修饰基团添加到这些RNA分子上，从而确保它们的正常功能。 microRNA是一类长度约为22个核苷酸的小RNA分子。它在基因表达调控中起着重要作用，能够与mRNA分子结合，并通过降解或抑制翻译来调控目标基因的表达。microRNA在细胞的发育、分化和凋亡等过程中发挥重要作用。
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