RSEM-Ebseq-差异表达分析-无参

最新推荐文章于 2024-05-23 09:48:17 发布
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文章标签： 操作系统 r语言
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本文介绍了如何使用RSEM和EBSeq进行无参数的差异表达分析。首先，详细阐述了RSEM的安装和使用步骤，包括准备参考序列、计算表达值等。接着，讲解了如何通过RSEM生成数据矩阵，并应用EBSeq进行分析，控制假阳性率以得到最终的差异表达结果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

1. RSEM的安装和使用：

  $ tar -xzf RSEM-1.3.0.tar.gz

  $ cd RSEM-1.3.0

  $ make

  $ make ebseq

  $ echo 'PATH=$PATH:/.../' >> ~/.bashrc

  $ source ~/.bashrc

               $ extract-transcript-to-gene-map-from-trinity trinity.fa gene_map （可选，转录本和基因都做）

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weixin_30602505
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