Pymol教程--移动对象模拟分子对接

本教程详细介绍了使用Pymol进行分子对接的步骤,包括分子和蛋白的分离、分子拖动、动画制作以及分子与蛋白的结合过程。通过Shift+滑轮操作实现分子动态结合,并利用mviewstore命令保存关键帧,为分子对接研究提供可视化指导。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

Pymol教程–移动对象模拟分子对接

本教程视频来源:钰沐菡 https://www.bilibili.com/video/BV19z4y1k7VN?spm_id_from=333.999.0.0

Step1 首先 蛋白和分子分离:选中分子后,sele->A->extract object

Step2 拖动分子:object01->A->drag matrix

Step3:开始拖动, Shift+按住滑轮,拖动;

Setp4: 开始做动画, mset 1x200, 当前画面保存第一帧:mview store, object=4lyw, 然后重复第二个对象:mview store, object=obj01

Setp5: 分子蛋白结合: Shift+按住滑轮,拖动;使分子与蛋白口袋结合

Setp6: 定位帧数:frame 170,保存当前动画:mview store, object=4lyw, 然后重复第二个对象:mview store, object=obj01

如果动画显示还是有问题:定位0帧, 重复Setp4的过程

其他内容:
定位停顿70帧:mview store, object=4lyw, 70

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