多维尺度分析（Multidimensional Scaling，MDS）

deepdata_cn

于 2024-06-06 08:00:00 发布

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分类专栏：数据科学文章标签：信息可视化多维尺度

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多维尺度分析（Multidimensional Scaling，MDS）是一种用于数据可视化和探索性数据分析的统计技术。它旨在通过将对象表示为多维空间中的点来揭示对象之间的相似性或差异性。MDS能够将高维数据转换为低维表示，同时尽可能保持原始数据中的相对距离或相似性。

一、基本概念

相似性或距离：
- MDS的出发点是对象间的相似性或距离度量。这些度量可以是定量的（如欧氏距离）或定性的（如相似性评分）。
相似性矩阵：
- 基于相似性或距离度量，构建一个相似性矩阵。这是一个方阵，其元素[ d_{ij} ]表示第( i )个和第( j )个对象之间的相似性或距离。
低维空间：
- MDS的目标是在低维空间（通常是二维或三维）中找到对象的表示，这些表示能够反映高维空间中的相似性或距离关系。
应力：
- 应力是MDS中的一个关键概念，用于量化低维空间中的距离与原始相似性矩阵之间的差异。目标是最小化应力，以获得最佳的低维表示。
MDS算法：
- 有多种MDS算法，包括经典的MDS（也称为度量MDS），它假定相似性度量遵循欧氏距离；非度量MDS，它不依赖于距离的具体度量；以及最小生成树MDS等。
优化：
- MDS通常涉及优化过程，以找到最小化应力的配置。这可能涉及迭代方法，如梯度下降或其他优化技术。

二、MDS的主要步骤

相似性矩阵的构建：
- 首先，需要确定对象间的相似性或距离度量。这可以是欧氏距离、余弦相似性或其他任何适当的度量。
- 基于这些相似性度量，构建一个相似性矩阵，其中矩阵的每个元素[ d_{ij} ]代表对象( i )和( j )之间的相似性或距离。
选择MDS类型：
- 有几种类型的MDS，包括经典的MDS、非度量MDS（不假设相似性度量遵循欧氏距离）和最小生成树MDS等。
- 选择哪种类型取决于数据的特性和研究目的。
计算MDS配置：
- 根据相似性矩阵，通过优化算法（如主成分分析PCA、梯度下降等）来确定每个对象在低维空间中的位置。
- 目标是最小化MDS应力函数，该函数衡量了低维空间中的距离与原始相似性矩阵之间的差异。
优化和迭代：
- 通常需要多次迭代来优化对象的位置，以最小化应力。
- 可以使用不同的优化技术，如梯度下降、共轭梯度法等。
解释和可视化：
- 一旦确定了对象在低维空间中的位置，就可以对结果进行解释和可视化。
- 可视化可以帮助理解数据中的模式、群组和关系。

三、应用场景

多维尺度分析（MDS）的应用场景非常广泛，它被用于多个学科和领域来探索和分析数据。

市场研究：
- 确定消费者对不同品牌或产品的认知和偏好。
- 比较消费者和非消费者对企业形象的感觉。
- 进行市场细分，将品牌和消费者在同一空间定位，然后分组归类具有相似感觉的消费者。
- 新产品开发，通过空间图寻找市场间隙，发现潜在商机。
- 评估广告效果，判断广告是否成功实现期望的品牌定位。
- 分析价格策略，推断价格对消费者感知的影响。
- 分销渠道策略，判断品牌对不同零售渠道的适应性。
心理学：
- 感知研究，分析人们对对象或概念的感知结构。
- 揭示个体之间的心理差异和相似性。
生物信息学：
- 基因表达数据或蛋白质序列相似性的分析，发现潜在的分类或进化关系。
地理信息系统：
- 分析地理位置或城市之间的相似性和距离关系，揭示空间结构和相互作用模式。
社会网络分析：
- 分析社交网络中个体间的亲密度或交互频率，揭示社区结构和影响力中心。
文本分析：
- 判断词语之间的语义相关性和结构。
产品设计和市场营销：
- 评价产品设计和市场营销中的广告。
跨文化研究：
- 比较不同文化背景下的感知和偏好差异。
城市规划：
- 分析城市规划中不同区域的功能和布局。
数据可视化：
- 将高维数据映射到二维或三维空间，便于直观地观察数据分布和结构。
  MDS作为一种强大的数据分析工具，能够帮助研究者和专业人士在各自的领域内探索数据的内在结构，发现潜在的模式和关系。

四、优点和局限性

1.优点：

能够揭示数据中的非线性结构。
适用于各种类型的相似性或距离度量。
可以处理非度量数据。
2.局限性：
需要选择合适的相似性度量和MDS类型。
计算成本可能较高，特别是对于大型数据集。
解释MDS结果可能需要专业知识。

五、Python应用

多维尺度分析（MDS）在Python中可以通过不同的库来实现，其中最著名的是scikit-learn（简称sklearn）库。

使用sklearn进行MDS分析：

首先，需要安装scikit-learn库，如果尚未安装，可以通过pip进行安装：
```
pip install scikit-learn
```

导入所需的库：

import numpy as np
from sklearn.manifold import MDS
import matplotlib.pyplot as plt

创建原始数据集，例如使用随机数据模拟高维样本：

np.random.seed(0)
X_high_dim = np.random.rand(5, 10)  # 5个样本，每个样本10个特征

计算样本间的欧氏距离矩阵：

from sklearn.metrics.pairwise import euclidean_distances
dist_matrix = euclidean_distances(X_high_dim)

实例化MDS模型并进行降维：

mds = MDS(n_components=2, dissimilarity='precomputed')
X_mds = mds.fit_transform(dist_matrix)

可视化降维后的结果：

plt.figure(figsize=(8, 6))
plt.scatter(X_mds[:, 0], X_mds[:, 1], s=100, color='steelblue', alpha=0.8)
plt.title('2D MDS Visualization')
plt.xlabel('Dimension 1')
plt.ylabel('Dimension 2')
plt.grid(True, linestyle='dotted')
plt.show()

MDS算法的优缺点分析：
- 优点：
  - 不需要先验知识，计算过程简单。
  - 能够保留数据在原始空间中的相对关系，提供良好的可视化效果。
- 缺点：
  - 如果用户对观测对象有先验知识，但无法通过参数化方法干预处理过程，可能无法达到预期效果。
  - 假设所有维度对目标的贡献相同，而实际情况可能并非如此。

使用MDS进行鸢尾花数据集降维：

加载鸢尾花数据集并应用MDS降维：

from sklearn import datasets, manifold
iris = datasets.load_iris()
X, y = iris.data, iris.target
mds = manifold.MDS(n_components=2)
X_mds = mds.fit_transform(X)