minfi 分析甲基化芯片数据-数据导入篇

minfi 是一个用于分析DNA 甲基化芯片的R包。官网如下：

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/minfi.html

如果要用这个包进行分析，首先需要在R中将我们的芯片数据读取进来，就是常说的import data。对于minfi 来说，其设计思路是通过读取SampleSheet.csv 文件，在事先约定好的目录结构中查找所有样本的原始数据，来自动化的读取所有样本的信息。

在illumina 的官方网站，我们可以找到对应的SampleSheet 文件的模板和测试数据集

1. 850K：

   https://support.illumina.com/array/array_kits/infinium-methylationepic-beadchip-kit/downloads.html

2. 450K ：

   https://support.illumina.com/array/array_kits/infinium_humanmethylation450_beadchip_kit/downloads.html

450K 芯片的SampleSheet.csv 模板示例如下：

在SampelSheet 文件中, 开头的几行是注释信息，[Data]