FactorBook:人和小鼠转录因子chip_seq数据库

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FactorBook整合了ENCODE数据库中人和小鼠的chip_seq数据，以转录因子为中心，进行了转录因子motif分析, 与其他转录因子或者组蛋白修饰的关联分析，数据库网址如下

http://www.factorbook.org/mouse/chipseq/tf/

在首页以矩阵的形式展现了数据分布，每一行代表一种转录因子，每一列代表一种细胞系，截图示意如下

1. Function

展示了refseq和wikipedia数据库中对该基因功能的描述，示意如下

同时还提供了PDB,GO等数据库的超链接，方便查相关信息，示意如下

2. Histone Profiles

对于转录因子的chip_seq数据，我们通常会分析在TSS位点两侧的富集情况。这部分内容将转录因子peak的中心区域当做TSS, 看组蛋白修饰的数据在转录因子peak中心区域的富集情况，结果示意如下