使用gdc-client批量下载TCGA数据

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GDC的在线下载功能只适用于下载小的数据集，当需要下载数据量较大的TCGA数据时，必须借助于GDC官方提供的客户端工具gdc-client。网址如下

https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool

该软件是一个命令行工具，支持windows, linux, mac OS多种操作系统，可以通过以下两种方法来下载文件

1. Manifest

首先通过GDC在线数据库筛选自己感兴趣的数据集，然后通过购物车图标将数据集添加到购物车中，示意如下

点击导航栏的Cart按钮，点击下载Manifest文件

该文件内容如下所示

第一列为文件的uuid, 在GDC数据库中，所有的信息都用一个uuid唯一标识。利用manifest文件批量下载的用法如下

gdc-client down