测序技术发展史、一二三代测序比较、测序下机数据文件格式fasta & fastaq、数据质控软件fastaqc

文章介绍了Fastaqc软件用于评估测序数据的碱基质量,通过可视化展示读段长度与质量的关系,绿色表示优质区域,粉色表示低质区域。测序质量较差的数据需进行严格的数据质控以确保后续生物信息学分析的准确性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

 

 

 Fastaq文件:

0.5: 测序错误概率

Fastaqc 这个软件可以查看测序的碱基质量好坏: 

左边:测序质量好,横轴是测序读段长度,纵轴是测序的碱基质量,绿色区域代表碱基质量好,粉红色区域代表质量差,中间区域代表质量中等。从左到右碱基基本位于绿色区域 

 测序差的数据要进行数据质控,

参考链接:让生信更简单投稿视频-让生信更简单视频分享-哔哩哔哩视频  (以上内容是B站前6个教学视频的PPT截图 )

 

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值