GhSAD1基因调节棉花的冷应激反应

摘要

冷胁迫是影响植物生长发育的主要环境因素。虽然有些植物已经产生了对冷胁迫的抵抗力，这一过程背后的分子机制知之甚少。使用全基因组关联作图 (GWAS)从不同地区收集的 200 个棉花种质的，我们发现了短链乙醇脱氢酶基因 GhSAD1 的变异，应对冷应激。病毒诱导的拟南芥基因沉默 (VIGS) 和过度表达表明 GhSAD1 在冷应激反应中发挥着重要作用。异位GhSAD1HapB 在拟南芥中的表达增加了耐寒性。GhSAD1HapB 的沉默导致脱落酸（ABA）含量降低。反之，过度表达GhSAD1HapB的ABA含量增加。GhSAD1HapB 调节棉花的冷应激反应通过调节 C 重复结合因子活性，从而调节 ABA 信号传导。GhSAD1 HapB 诱导 COLD-REGULATED (COR) 基因的表达并增加与冷应激耐受性相关的代谢物水平。GhSAD1HapB 的过表达部分补充了 aba2-1 突变体的表型。总的来说，研究结果增加了我们对 GhSAD1 介导的棉花的冷应激机制的理解。

材料方法

200个陆地棉种质种子。包括来自黄河（YR）的 58 个，来自西北（NW）的 81 个，长江（YZR）25个，东北15个，外国地区（FR）21个。对于冷应激实验，将 200 个种质生长到子叶阶段，然后在受控室中经受 4°C 的温度 5 天。此后，将植物转移到具有（16h 26°C /8h 22°C）光照/黑暗条件的温室中进行恢复。使用两个独立的生物学重复进行实验。

重测序和GWAS分析

GATK 用于重新校准碱基质量分数，以便使用设置为已知位点的并流变化来获得每个碱基的更准确的质量分数。通过重新校准基础质量得分获得的数据用于 GATK 中的HaplotypeCaller 进