爆火的孟德尔随机化，原来可以很简单？双向孟德尔随机化+基因组数据发了二区！...

找到创新点，发文并不难！无论是高分还是顶级期刊，孟德尔随机化都能助你一臂之力！今天我们来看一篇“简单”的文章，用双向孟德尔随机化方法探讨睡眠特征与甲状腺癌之间的因果关系，发了二区！让我们一起往下看吧！

2024年5月17日，中国人民解放军总医院的研究团队做了一项孟德尔随机化研究，在期刊《Bmc Cancer》（医学二区top，IF=3.8）发表了题为：“Causal association of sleep traits with the riskof thyroid cancer: A mendelian randomization study”的研究论文，本研究旨在基于孟德尔随机化(MR)分析，探讨睡眠时间、打鼾、睡眠类型、睡眠障碍、早晨起床、失眠和白天午睡等睡眠特征与甲状腺癌风险的因果关系。

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近年来，睡眠与癌症的关系受到广泛关注。“睡得少噶得早”真不是危言耸听，已有研究表明昼夜节律紊乱不仅会影响增加炎症，还会影响甲状腺功能，进而导致甲状腺肿瘤的发生！

为探究睡眠特征与甲状腺癌的风险之间是否有因果关系，中国学者开展了一箱孟德尔随机化研究，研究流程如下：

主要研究结果

1.研究设计

本研究使用FinnGen和英国生物银行（UK Biobank）数据库中的GWAS数据，包括意大利和芬兰人群的睡眠特征和甲状腺癌风险相关数据。

• 最终纳入了18个与睡眠持续时间相关的SNP，28个与打鼾相关的SNP，10个与时间型相关的SNP，3个与睡眠障碍相关的SNP，74个与早上起床相关的SNP，39个与失眠相关的SNP，以及91个与白天午睡相关的SNP。

2.不同睡眠特征与甲状腺癌相关性的MR分析结果：

• 在意大利人群中，早上起床和白天小睡与甲状腺癌风险的降低相关(OR=0.055, 95%CI: 0.004-0.741; OR=0.031, 95%CI: 0.002-0.462)。

• 在芬兰人群中，睡眠时长减少与甲状腺癌风险的显著增加相关(OR=7.307, 95%CI: 1.642-32.519)。

• 同时，芬兰人的睡眠类型也与甲状腺癌风险的降低相关(OR=0.282, 95%CI: 0.085-0.939)。

• 而且，睡眠障碍与芬兰人甲状腺癌风险的增加相关(OR=2.298, 95%CI: 1.194-4.422)。

综合分析显示，睡眠时长的减少与甲状腺癌风险的显著增加相关(OR=5.600, 95%CI: 1.458-21.486)。

加权中位数/MR-RAPS/MR-PRESSO 结果对芬兰人群睡眠时间缩短与甲状腺癌之间关系的散点图如图所示：

3.敏感性分析结果

在芬兰人群中，采用留一法（机器学习）逐渐去除异常值SNP，结果表明时间型与甲状腺癌风险的因果关系无统计学意义。

• 根据MR-PRESSO 结果，rs2050122 是异常值 SNP。

• MR结果排除了异常值SNP，结果如下图，这表明睡眠时间减少与甲状腺癌风险的因果关系在芬兰人群中具有统计学意义。

在意大利人群中，同样采用留一法进行评估，结果表明早上起床和白天小睡与意大利人群患甲状腺癌的风险之间有很强的因果关系。

• MR-Egger 和 IVW 方法的 Cochran's Q 显示睡眠时间缩短与甲状腺癌风险之间的关联存在异质性。

• 去除MR-PRESSO 检测到的异常值 SNP后差异无统计学意义，结果与IVW结果相似

4.反向孟德尔随机化（MR）结果

研究团队进行了的反向MR分析来探索反向因果关系，分析步骤与上述MR分析相同。

• 研究结果显示，没有证据表明甲状腺癌(作为暴露)与睡眠特征(作为结果)之间存在反向因果关系。

统计学方法

本文的研究思路非常流畅，方法简单且简洁明了！

筛选有效的SNP：

• 先筛选作为工作变量的SNP，再开展MR分析研究。

孟德尔随机化（MR）分析：

• IVW方法作为本研究的主要分析方法，用于基本因果估计；

• 加权中位数方法可有效防止使用变量，也可以提供一致的因果效应估计；

• MR-RAPS可以提供稳健的推断；

• MR-PRESSO 分析去除显著的异常值，检测并减少水平多效性；

• 采用留一分析来评估结果是否由与睡眠特征相关的任何单个SNP引起。

敏感性分析：

• 进行了Cochran的Q检验，以评估IVW方法中SNPs之间的统计异质性，并将P < 0.05设置为显着异质性。

反向孟德尔随机化（MR）分析：

• 使用反向MR分析以评估睡眠特征与甲状腺癌之间的因果关系。

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后   记

还是要早睡啊！本文使用的方法真的简单，就是孟德尔随机化和反向孟德尔随机化，评估了睡眠特征与甲状腺癌风险之间的因果关系，结果发了二区！

现如今，孟德尔随机化不仅仅局限于简单的模式，例如两样本孟德尔随机化。稍微打开一下思路，例如与组学结合，轻松就能发表二区！

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