基因功能预测工具-HMMER的安装

最近几天需要集中安装软件，尤其是不需要conda安装的，存在依赖的软件，尽量的自己去配置环境变量，针对个别在安装时报错的软件，简单记录一下，等过段时间有了数据后，会再具体的写一些这些软件的具体使用方法，结果解读。先简单说一下HMMER安装过程吧。

从功能基因研究的角度来讲，相关的搜索，比如从序列数据库中，找同源的序列，或者对一个新的基因功能进行鉴定，使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度以及更高的搜索速度，但其应用远没有blast普及。

• 下载官网

http://hmmer.org/

下载后tar -zxvf 解压， cd

./configure --prefix=/public/home/myname/software/hmmer-3.3.2

发现提醒No python3 found,看样子这个软件依赖python3，而服务器上安装的是python2.7.5,下载python3。

下载链接：https://www.python.org/ftp/python/3.7.0/

然后tar -xzvf Python-3.7.0.tgz解压

./configure --prefix=/public/home/myname/software/Python-3.7.0

make

make install

运行完后，出现下面结果，提示安装成功，然后修改环境变量：

修改环境变量

vi ~/.bashrc

exportPATH=“$PATH:/public/home/myname/software/Python-3.7.0/bin”

source~/.bashrc

再重新对HMMER进行编译，解决

然后make && make install, 进入bin/目录下，试一下，出现下面信息，提示安装成功。