在线差异基因分析 (支持自动和指定批次校正)

高颜值绘图工具ImageGP不只可以绘制常见的生信图形,还提供了不少分析功能,如之前提到的在线WGCNA分析,操作简单,参数丰富,结果交互,绝对是科研必备神器。

访问也很简单,百度或谷歌搜索ImageGP即可打开页面 http://www.ehbio.com/Cloud_Platform/front/#/

这次介绍的是在线差异基因分析,支持芯片数据、转录组(CPM和reads count)、扩增子、宏基因组等其他高通量数据分析。

操作也很简单,提供表达矩阵和分组信息,即可完成任意两组之间的差异分析,并输出结果报告。

提交后获得结果

更可以进行批次的自动校正

复杂组合的比较

想了解具体原理,查看下面3篇推文

高通量数据中批次效应的鉴定和处理 - 系列总结和更新

DESeq2差异基因分析和批次效应移除

什么?你做的差异基因方法不合适?

典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集

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