AI医药论文笔记--Machine learning-based prediction of drug–drug interactions by integrating drug phenotypic

该博客介绍了利用机器学习的异构网络辅助推理(HNAI)框架,预测药物-药物相互作用(DDI)。通过整合药物的表型、治疗、化学和基因组特性,构建了包含朴素贝叶斯、决策树、k-最近邻、逻辑回归和支持向量机的预测模型。数据来源于DrugBank和多个数据库,模型经过五重交叉验证,提高了DDI预测的准确性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

基于机器学习的药物-药物相互作用预测–通过整合药物表型、治疗、化学和基因组特性

论文题目 Machine learning-based prediction of drug–drug interactions by integrating drug phenotypic, therapeutic, chemical, and genomic properties
论文出自 JAMIA

一、模型框架?

提出了一个异构网络辅助推理(HNAI)框架来帮助预测 DDI。
在这里插入图片描述
用于预测药物-药物相互作用 (DDI) 的异构网络辅助推理 (HNAI) 框架。

(A) 从 DrugBank 数据库中收集全面的 DDI 数据集并构建 DDI 网络。

(B) 计算四种药物-药物对相似性。 表型相似性基于全面的药物-不良药物反应网络,治疗相似性基于药物解剖学治疗化学(ATC)分类系统,结构相似性源自化学结构数据,基因组相似性基于大药物-靶点 来自 DrugBank 和治疗目标数据库的交互网络。 使用先前公布的方法计算药物表型、治疗和结构相似性。

(C) 基于机器学习的 HNAI 模型的构建和评估。

主要步骤:

1、首先构建了一个全面的 DDI 网络,其中包含 6946 个独特的 DDI 对&#x

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