非靶代谢组数据处理（网站简单式）

1.数据准备

准备data.csv文件，格式如下

1. 第一列是代谢物名字

2. 第一行是样品名字

3. 第二行是样品分组

4. 每个格子填充的是峰面积

按照这个格式把代谢组数据整理好

2. 代谢组分析网站

https://www.metaboanalyst.ca/

点击start

把1中准备的数据文件选上，format和data type按图中选，submit

这步可以点edit groups检查一下分组情况，一般识别没啥问题，点proceed

data filter 主要是筛掉一些质量差的物质，根据自己需要进行选择，也可以不过滤，直接点proceed

normalization 主要是对峰面积数据进行均一化，可以按图中选择，也可以自行选择，点normalize，完成后点proceed

完成，可以进行很多分析，自行选择，自己感兴趣的点一下就行，比如点一下volcano plot

左侧可以做很多分析，最后点击download

点过的分析产生的图片和数据文件都会出现在这，箭头指的这两个文件比较重要

data_normalized主要是把峰面积数据均一化后的结果，文件格式和原始导入的一样

volcano.csv主要是火山图作图的数据，里面会有代谢物的fold change 和 p value