MicroPIT挑选进行宏基因组测序分析

做扩增子测序后，你也一定还会想要进行shutgun宏基因组测序， 但宏基因组测序单个样品价格又太高不可能把你的每个样品都去进行宏基因组测序。 所以这时我们就可以利用microPITA进行样品预测，挑选出合适的样品。该分析是基于大量微生物多样性的数据，根据不同指标筛选出代表性样本，开展宏基因组研究，关于microPITA的介绍如下：

另：microPITA分析需要您提供otu taxa table，并告知分组情况即可；

microPITA 支持2种数据格式：pcl和biom文件。Biom文件大家都很熟悉，主要来介绍一下pcl文件：

默认的格式如上图所示：

1. 第一行为样品的ID。