RNA-seq FPKM&RPKM&TPM的介绍区别

最新推荐文章于 2022-12-06 21:31:25 发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/ACGTexplorer/article/details/116611265
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一直以来对这几个概念都很混淆，今天发现了一个好帖子，讲的很仔细，总结下来就是：
FPKM,RPKM和TPM均是根据测序深度及基因长度标准化的测序数据
其中，FPKM,RPKM计算方法一样，先进行测序深度标化，再进行基因长度标化；
TPM先进行基因长度标化，再进行测序深度标化

TPM数值能体现出比对上某个基因的reads的比例，该数值可以直接进行样本间的比较。

详细的帖子如下：
http://www.360doc.com/content/18/0112/02/50153987_721216719.shtml
还有youtube的视频
https://www.youtube.com/watch?v=TTUrtCY2k-w

RNA-seq其他的标准化方法_ERCC_spike in
https://www.jianshu.com/p/cd2888fec66b

橙子榴莲巧克力
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