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转录调控网络是生物学研究的重要领域，涉及转录因子和TFBS，与基因表达、疾病机制及进化分析密切相关。高通量测序技术的发展促进了转录因子数据库的建立，为基因调控分析、疾病研究和进化分析提供数据支持。转录组学研究基因转录情况，蛋白质组学关注蛋白质表达，代谢组学分析代谢物变化，表观遗传学探讨非序列改变的遗传表达，而功能基因组学则系统研究基因功能。这些组学研究共同揭示生命活动的复杂规律。
基因转录调控网络——转录因子调控网络分析
转录因子(Transcription Factors, TFs)是指
能够以序列特异性方式结合DNA并且调节转录的蛋白质。
转录因子通过识别特定的DNA序列来控制染色质和转录，以形成指导基因组表达的复杂系统。
转录水平的调控是基因调控的重要环节，其中转录因子(Transcription Factor，TF)和转录因子结合位点(Transcription Factor Binding Site，TFBS)是转录调控的重要组成部分。
基因转录调控网络由于其可以直观地显示基因表达调控关系，已成为生物学研究的热点之一。近年来，随着高通量测序技术的发展，产生了大量用于鉴定转录因子及其结合位点的高通量实验数据。为了系统地收集、整理和分析这些数据，产生了许多相关的转录因子数据库。 转录因子占所有人类基因的约8％，并且与多种疾病和表型相关。因此基因转录调控网络分析将为基因调控、组织分化、疾病发生等相关研究提供了必要的数据参考。
主要应用领域：基因调控分析、疾病研究（例如疾病产生和发展机制，组织分化等）、进化分析（表观遗传）
分析过程简图：
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