转录因子调控网络分析

简介

转录因子(Transcription Factors, TFs)是指能够以序列特异性方式结合DNA并且调节转录的蛋白质。转录因子通过识别特定的DNA序列来控制染色质和转录,以形成指导基因组表达的复杂系统。转录水平的调控是基因调控的重要环节,其中转录因子(Transcription Factor,TF)和转录因子结合位点(Transcription Factor Binding Site,TFBS)是转录调控的重要组成部分。基因转录调控网络由于其可以直观地显示基因表达调控关系,已成为生物学研究的热点之一。近年来,随着高通量测序技术的发展,产生了大量用于鉴定转录因子及其结合位点的高通量实验数据。为了系统地收集、整理和分析这些数据,产生了许多相关的转录因子数据库。 转录因子占所有人类基因的约8%,并且与多种疾病和表型相关。因此转录因子调控网络分析将为基因调控、组织分化、疾病发生等相关研究提供了必要的数据参考。

应用领域

  1. 基因调控分析;
  2. 疾病基础研究:如疾病的发生与发展机制研究,组织分化;
  3. 进化分析。

分析流程

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