分子对接筛选定制之酶抑制剂靶点预测
小编分享分子对接筛选定制,一起来看:
分子对接,通过研究配体小分子和受体生物大分子的相互作用,预测其亲和力,实现基于结构的药物设计的一种重要方法。
分子对接:是将已知三维结构数据库中的分子逐一放在靶标分子的活性位点处。通过不断优化受体化合物的位置、构象、分子内部可旋转键的二面角和受体的氨基酸残基侧链和骨架,寻找受体小分子化合物与靶标大分子作用的ZuiJia构象,并YuCe其结合模式、亲和力和通过打分函数挑选出接近天然构象的与受体亲和力ZuiJia的配体的一种理论模拟分子间作用的方法。
原理:
按照受体与配体的形状互补,性质互补原则,对于相关的受体按其三维结构在小分子数据库直接搜索可能的配体,并将它放置在受体的活性位点处,寻找其合理的放置取向和构象,使得配体与受体形状互补,性质互补为ZuiJia匹配。
分类:
- 刚性对接
- 半柔性对接
- 柔性对接
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