Science项目文章 | 中国农科院作科所研究团队解析“复粒稻”多粒簇生的机制_enhancing rice panicle branching and grain yield t-CSDN博客

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2024年3月8日，由中国农业科学院作物科学研究所童红宁研究员领衔的研究团队在Science发表题为“Enhancing rice panicle branching and grain yield through tissue-specific brassinosteroid inhibition”的研究论文。该研究报道了复粒稻多粒簇形成的机制，揭示了BRs在通过精确的分生组织过渡来协调穗分枝和粒数方面的开创性作用。其中，研究找到BR分解代谢基因油菜素内酯缺乏的DWARF3（BRD3），还发现了一种支持这一功能的组织特异性BR通路，涉及BR信号抑制剂激酶GSK2，它可以磷酸化并稳定转录因子OsMADS1。随后，研究利用ChIP-seq和RNA-seq找到了OsMADS1的下游靶基因RCN2；进而确定了组织特异性的BR通路（BRD3-BR-GSK2-OsMADS1-RCN2）。爱基百客为该研究提供ChIP-seq和RNA-seq的技术支持。

研究背景

作物育种本质上是在平衡各种特征以实现植物最佳表现的艺术。然而，由于特征之间复杂的关系，实现最佳平衡具有挑战性。一个主要障碍是各种特征之间的权衡，比如谷粒大小和数量之间的权衡。植物甾醇（BRs）是一类类固醇激素，促进谷粒大小并已被证明可以增强作物产量。尽管它们具有潜力，但BRs的多效性影响阻碍了它们在作物改良中的应用，并且它们在调节谷粒数量方面的作用仍不清楚。

研究结果

1. CL提高了穗分枝和籽粒产量，分枝时间延长导致籽粒数增加

CL1是典型的CL（clustered-spikelet rice，聚类小穗水稻/复粒稻）品种，呈簇状生长，主要由三粒组成。为了便于比较，研究团队利用CL1作为回交亲本，培育了一个非CL品种（NCL1）。然后，从形态、穗长、穗数、抽穗日期、千粒重、产量和籽粒质量等方面进行了比较。总的来说，CL促进了籽粒数和产量。这些结果也表明，CL特征在作物改良方面具有巨大潜力。

在水稻穗发育过程中，依次产生了一系列具有不同特征的横向分生组织（图1R）。研究对穗状体发育过程进行了电镜扫描（图1S-V）。基于这些观察，研究团队得出结论，有三种发育现象驱动了CL的形成：(i)更多的SBMs（次级分生组织）的发育，（ii）多生SM（小穗分生组织）的启动，以及（iii）缩短的花梗。

图1：CL促进了籽粒数和产量。

2. 通过筛选CL抑制因子来克隆致病基因

采用化学方法诱变CL，从10000个独立突变系（M1）中，检测M2植物的表型（每株16个），鉴定出两个恢复为野生型NCL表型（不簇生）的突变系，将其命名为cl1-1和cl1-2（图2B）。通过比较从cl1×CL1回交的F2群体中汇总的NCL和CL植株，研究发现，与CL1相似，cl1-1和cl1-2的谷物数量显著减少，因为它们的次生分枝数量较少（图2D-F）。两种突变体均具有与NCL1和CL1相同的植株结构、穗数、穗长和千粒重。利用BSA，鉴定到一个关键基因BRD3（BR代谢酶基因）。研究使用CRISPR-Cas9技术在CL1背景下编辑BRD3基因。所有的编辑品系（包含移码突变））（cl-cc）均显示出NCL表型。此外，与NCL1相似，cl-cc敲除突变体与CL1相比，株粒数和产量减少，而在穗长、穗数和粒重方面没有显著差异。这些分析提供了强有力的证据，表明所鉴定的候选基因负责CL表型和提高籽粒生产力。