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单细胞测序
文章平均质量分 89
爱基百客
这个作者很懒,什么都没留下…
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单细胞+RIP-seq项目文章| Cell Reports&hnRNPU蛋白在小鼠精原干细胞池建立的关键作用
精原干细胞(SSCs)是负责精子发生的干细胞,具有自我更新和分化产生功能性精子的能力。SSCs的持续再生对于维持雄性生育力至关重要。然而,SSC池的发育起源尚不清楚。在哺乳动物中,SSCs源自名为 prospermatogonia(ProSG)的前精原细胞,依次发育为增殖型前精原细胞(M-ProSG)、初级过渡型前精原细胞(T1-ProSG)和次级过渡型前精原细胞(T2-ProSG)三种类型。ProSG的迁移和分化过程对于SSC池的建立至关重要,但这一过程的调控机制仍不完全清楚。2024年04月原创 2024-04-22 11:56:59 · 961 阅读 · 0 评论 -
Nucleic Acids Research | scATAC-seq+CUT&Tag探究关键转录因子对视网膜细胞分化的调控作用
本文利用scATAC-seq和CUT&Tag技术,研究了视网膜细胞分化过程中的表观遗传景观变化,发现不同细胞状态的增强子活性差异可将视网膜细胞分组,并揭示了细胞发育轨迹中基因表达与表观遗传景观的关系。从nRPCs到tRPCs再到特定神经元的发育轨迹中,细胞状态特异性增强子的活性变化导致基因表达变化。转录因子在调控表观遗传景观和基因表达中发挥关键作用。研究结果支持关键转录因子在推动细胞向不同谱系发展中既合作又竞争的模式。原创 2024-03-04 09:14:17 · 801 阅读 · 0 评论 -
肿瘤的转录调控:Cell子刊揭示原发性肝癌中转录因子活性的全基因组图谱|国自然热点
2023年11月,美国国家癌症研究中心的研究团队在Cell Reports期刊(IF=8.8)上发表了题为“Genome-wide profiling of transcription factor activity in primary liver cancer using single-cell ATAC sequencing”的文章。研究人员通过对16例原发性肝细胞癌(PLC)患者,包括13例HCC和3例iCCA,进行单细胞ATAC-seq,发现了31个转录因子的基序富集水平可以区分肝细胞癌(HCC)原创 2024-01-23 16:53:48 · 946 阅读 · 0 评论 -
Cell Reports | 表观组学和单细胞测序揭示在急性应激条件下FoxM1协调β细胞亚群的细胞分裂、蛋白质合成和线粒体活性
胰腺β细胞是一种长寿的终末分化细胞,对维持葡萄糖稳态至关重要。作者采用成年小鼠β细胞补偿的急性胰岛素抵抗模型,研究染色质重塑和基因表达的时间序列,观察到染色质重组具有显著的早期可塑性,以及控制细胞分裂和蛋白质合成的增殖β细胞(PβCs)的独特转录和功能特征。重要的是,作者发现FoxM1调节蛋白质翻译、内质网应激反应、线粒体生物发生和β细胞活性。原创 2023-11-03 13:52:33 · 129 阅读 · 0 评论 -
5篇IF值20+的高分文章了解国自然热点“免疫调控”研究思路
根据对往年国自然中标结果进行分析,发现免疫调控仍占据着重要的地位,成为一个不可忽视的研究方向。尤其是对近10年免疫调控项目的中标数进行统计,发现免疫调控的中标数一直趋于上升趋势,可见大家对于这一研究方向的热衷。原创 2023-09-25 11:33:36 · 204 阅读 · 0 评论 -
年终盘点 | 从Cancer Cell到Nat Plants,高分项目文章盘点
爱基百客年终高分项目文章盘点·······原创 2023-01-04 13:54:37 · 181 阅读 · 0 评论 -
文献解读 | 单细胞转录组图谱揭示了茶叶中儿茶素酯的发育轨迹和新的代谢途径
作者通过原生质体分离、单细胞测序和细胞特异性组织分离构建了第一个木本茶树单细胞水平图谱。此外,还鉴定了每个细胞簇和茶叶细胞类型的特定标记基因。首次在体外和体内鉴定出一种尿苷二磷酸依赖性糖基转移酶(UGT),该酶参与儿茶素酯的糖基化,揭示了对植物中儿茶素酯代谢的复杂发育调控的见解。原创 2022-12-13 15:04:40 · 447 阅读 · 0 评论 -
单细胞专题 | 带你“走近”单细胞转录组测序
单细胞转录组测序科普原创 2022-11-17 09:44:47 · 1202 阅读 · 0 评论 -
文献解读 | 单细胞转录组助力解析水稻早期花序的发育轨迹机制
作者利用单细胞转录组对水稻花序进行分析,构建了涵盖早期生殖发育过程中从花序到小花转变的单细胞动态全景图。原创 2022-11-14 14:05:27 · 483 阅读 · 0 评论 -
文献解读|PBJ 白菜单细胞转录组揭示植物叶片腹背面细胞分化差异的分子机制
白菜单细胞转录组图谱原创 2022-11-09 13:51:05 · 426 阅读 · 0 评论