生信技能44 - 西湖(中国)生物样本库汉人数据下载和等位基因频率过滤VCF

最新推荐文章于 2024-09-07 19:50:32 发布
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分类专栏： 生信分析项目实战技能合集 文章标签： 数据分析 数据挖掘 linux
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本文链接：https://blog.csdn.net/LittleComputerRobot/article/details/137957966
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本文介绍了西湖(中国)生物样本库(WBBC)，提供了汉人的基因数据批量下载，并详细解析了VCF文件中的关键信息，如等位基因频率。通过Python脚本`filter_frequency.py`，提取了等位基因频率在0.49-0.51之间的VCF信息。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Westlake BioBank for Chinese (WBBC) 西湖(中国)生物样本库

WBBC，施一公当校长的西湖大学，共纳入~15000个样本，目前提供了hg19和hg38两个版本的数据下载。

WBBC网址：https://wbbc.westlake.edu.cn/downloads.html

1. 可用数据（汉人）

在这里插入图片描述

WBBC网站

2. 批量下载数据（hg38/hg19）

后台下载
nohup sh download_WBBC.sh > download.log 2&>1 &

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生信与基因组学
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