Nature子刊：单细胞转录组在生殖领域新发现

SHANGHAILINGEN

于 2024-09-30 10:28:22 发布

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文章标签：测序组学

本文链接：https://blog.csdn.net/SHANGHAILINGEN/article/details/142651106

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本期分享一篇发表在Nature Communications的文章“VGLL1 cooperates with TEAD4 to control human trophectoderm lineage specification”，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因编辑、转录因子结合位点和染色质可及性等分析方法，成功揭示了VGLL1/TEAD4是人滋养外胚层谱系中细胞命运决定和自我更新的核心调节因子。

影响因子：16.6
发表日期：2024年1月17日
DOI:10.1038/s41467-024-44780-8

研/究/背/景

人类胎盘主要由囊胚期的滋养外胚层（TE）发育而成。滋养外胚层的异常发育分化将导致胚胎着床失败或者胎盘功能障碍，继而引发严重的妊娠疾病，增加胎儿流产率和死亡率。因此，探索TE谱系调控机制对于胚胎早期发育领域至关重要。

研/究/方/法

使用转录因子分析、单细胞RNA测序、基因编辑、转录因子结合位点分析、染色质可及性分析等研究方法，为人类滋养外胚层功能与胚胎植入失败等临床问题提供了新的研究视角。

主/要/结/果

1.VGLL1在人类naive PSCs诱导至TELC的过程中高度表达

使用4CL培养基生成的人类naive PSCs来产生TE细胞（TELCs）。基于单细胞RNA测序，筛选出naïve PSCs和TELC细胞之间的差异表达基因，其中VGLL1基因上调最显著。通过免疫荧光显微镜、RT-qPCR和蛋白质印迹等方法证实VGLL1在TELCs中高度表达。

图转录辅助因子VGLL1在人TE诱导过程中高表达

2、VGLL1与TEAD4协同作用调节人类TELC谱系发生

Motif分析发现TEAD4在VGLL1结合位点高度富集。免疫共沉淀结果显示VGLL1和TEAD4有强烈的相互作用。推测VGLL1与TEAD4形成复合体来调节人TELC的诱导。

图 VGLL1与TEAD4相互作用调节人naïve PSC到TELC的诱导

3、VGLL1-TEAD4 与 GATA3 和 TFAP2C 合作控制人TELC 基因调控网络

已知GATA3与VGLL1启动子结合，促进其在人滋养细胞表达。对GATA3和TFAP2C进行了CUT&Tag，结果显示VGLL1-TEAD4复合物与这两个转录因子协同作用，且高结合位点分享率说明VGLL1、TEAD4和GATA3具有较强的功能相关性。此外，共免疫沉淀结果证明这四种因子在TELC-D5细胞中相互作用，支持以上观点。