(二)外显子组数据分析之原始数据sra数据下载

写在前面:

由于是拿数据练手,因此并没有外显子测序原始数据,因此通过阅读文献,下载文献中使用的数据。

1. 查找外显子测序数据:
通过阅读文献,找到外显子测序数据, 但是有些数据不是开源的,无法获取,因此,可能需要多找几篇文献,找到可以下载的数据源。
1.1. 找到外显子测序数据源文献:Reliability of Whole-Exome Sequencing for Assessing Intratumor Genetic Heterogeneity (研究乳腺癌)
1.2. 根据文章内容查找原文数据存放在哪里?The accession number for the raw data from WES and AmpliSeq sequences reported in this paper is SRA: SRP070662.
于是打开NCBI,输入编号,如下图所示:
在这里插入图片描述
不同样本的数据存放在不同的条目下面。点开第一条,显示如下:

这里面清晰的记录了数据的样本信息,来源, 研究等信息。
2. SRA数据下载
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